Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 YOR248WYOR248W 303 nt0.9□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YBR071WYBR071W 636 nt0.9□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 KAP120YPL125W 3099 nt0.9□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 SLX4YLR135W 2247 nt0.9□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 MAK10YEL053C 2202 nt0.89□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 SEC3YER008C 4011 nt0.89□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.89□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 SLM6YBR266C 453 nt0.89□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 CDC39YCR093W 6327 nt0.89□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 MET32YDR253C 576 nt0.88□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.88□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.88□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YBL073WYBL073W 312 nt0.88□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YPR099CYPR099C 357 nt0.88□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 EAF1YDR359C 2949 nt0.87□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YDL152WYDL152W 366 nt0.87□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 PAU2YEL049W 363 nt0.87□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 RTR1YER139C 681 nt0.87□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 RTT102YGR275W 474 nt0.87□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 snR13snR13 124 nt0.87□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 PAN3YKL025C 2040 nt0.87□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.86□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YDR509WYDR509W 348 nt0.86□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 PRE4YFR050C 801 nt0.86□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 EAF6YJR082C 342 nt0.86□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 AIM29YKR074W 468 nt0.86□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.86□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YBR032WYBR032W 303 nt0.86□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 TSC3YBR058C-A 243 nt0.86□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YLL054CYLL054C 2532 nt0.85□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 PBI2YNL015W 228 nt0.85□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 SGO1YOR073W 1773 nt0.85□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 UBP3YER151C 2739 nt0.85□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 SAS3YBL052C 2496 nt0.84□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 STB6YKL072W 2301 nt0.84□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 SWI4YER111C 3282 nt0.84□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 SWI5YDR146C 2130 nt0.84□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YGR045CYGR045C 363 nt0.84□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 RPL9BYNL067W 576 nt0.84□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 TOM22YNL131W 459 nt0.84□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.84□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 snR189snR189 189 nt0.84□□□□□ -2.27
RIO1Q12196 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.84□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 CLU1YMR012W 3834 nt0.84□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 PIP2YOR363C 2991 nt0.83□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 YCR001WYCR001W 315 nt0.83□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 TMA22YJR014W 597 nt0.83□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 NFU1YKL040C 771 nt0.83□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 RPL32YBL092W 393 nt0.83□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 GDS1YOR355W 1569 nt0.83□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 PHS1YJL097W 654 nt0.82□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 YML108WYML108W 318 nt0.82□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 YOP1YPR028W 543 nt0.82□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 HDA3YPR179C 1968 nt0.82□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 SPT21YMR179W 2277 nt0.81□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.81□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.81□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 BIG1YHR101C 1008 nt0.81□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 URM1YIL008W 300 nt0.81□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.81□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 IRC23YOR044W 474 nt0.81□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 APL3YBL037W 3078 nt0.8□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 NHP2YDL208W 471 nt0.8□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 YDR008CYDR008C 351 nt0.8□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 MXR1YER042W 555 nt0.8□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 RUF22RUF22 515 nt0.8□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 YNL122CYNL122C 348 nt0.8□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 LOA1YPR139C 903 nt0.8□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 PXA2YKL188C 2562 nt0.79□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 WIP1YDR374W-A 270 nt0.79□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 RPL16AYIL133C 600 nt0.79□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 SDH2YLL041C 801 nt0.79□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.79□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 snR41snR41 95 nt0.79□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 MKT1YNL085W 2493 nt0.78□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 YDR521WYDR521W 336 nt0.78□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 BI2Q0110 1272 nt0.78□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 NBL1YHR199C-A 222 nt0.78□□□□□ -2.28
RIO1Q12196 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.78□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YCS4YLR272C 3531 nt0.77□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 TOF2YKR010C 2316 nt0.77□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.77□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.77□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 ATP19YOL077W-A 207 nt0.77□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 ZIP1YDR285W 2628 nt0.77□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 SPO23YBR250W 1572 nt0.76□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 CYC7YEL039C 342 nt0.76□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 CMC4YMR194C-B 222 nt0.76□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 LYS14YDR034C 2373 nt0.75□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 ZEO1YOL109W 342 nt0.75□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 NUT2YPR168W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 SEC1YDR164C 2175 nt0.74□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 NUT1YGL151W 3399 nt0.74□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 NOC3YLR002C 1992 nt0.74□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YGL239CYGL239C 315 nt0.74□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.74□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 UBC7YMR022W 498 nt0.74□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 NUP145YGL092W 3954 nt0.74□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 AIM9YER080W 1884 nt0.73□□□□□ -2.29
RIO1Q12196 SLD3YGL113W 2007 nt0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.3 ms