Protein–RNA interactions for Protein: Q12106

MCP1, MDM10-complementing protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCP1Q12106 YPR039WYPR039W 336 nt0.8□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 MPT5YGL178W 2580 nt0.8□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 YKL044WYKL044W 321 nt0.79□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 BER1YLR412W 825 nt0.79□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 STB6YKL072W 2301 nt0.79□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.79□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 IFH1YLR223C 3258 nt0.78□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 YDR008CYDR008C 351 nt0.78□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 YDR114CYDR114C 303 nt0.78□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 NUT2YPR168W 474 nt0.78□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 APL3YBL037W 3078 nt0.78□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 NUT1YGL151W 3399 nt0.78□□□□□ -2.28
MCP1Q12106 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.77□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 SVS1YPL163C 783 nt0.77□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 SPO23YBR250W 1572 nt0.77□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 LYS14YDR034C 2373 nt0.77□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 SWI6YLR182W 2412 nt0.76□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 STF2YGR008C 255 nt0.76□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 SDH2YLL041C 801 nt0.76□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.76□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 ERP4YOR016C 624 nt0.76□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 SCW11YGL028C 1629 nt0.75□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YFL012WYFL012W 447 nt0.75□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 TMA22YJR014W 597 nt0.75□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.75□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YBR012CYBR012C 420 nt0.75□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 CDC39YCR093W 6327 nt0.75□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 RPL16AYIL133C 600 nt0.74□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 PAM16YJL104W 450 nt0.74□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YJR141WYJR141W 1044 nt0.74□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 IRC23YOR044W 474 nt0.74□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.74□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 AIM9YER080W 1884 nt0.73□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 SAS3YBL052C 2496 nt0.73□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 OCA6YDR067C 675 nt0.73□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 HIT1YJR055W 495 nt0.73□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.73□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 RUF22RUF22 515 nt0.73□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 FIG4YNL325C 2640 nt0.73□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YCS4YLR272C 3531 nt0.73□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 KAP120YPL125W 3099 nt0.73□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 CYC7YEL039C 342 nt0.72□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YGR045CYGR045C 363 nt0.72□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.72□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 UBX4YMR067C 1251 nt0.72□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.72□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 PXA2YKL188C 2562 nt0.72□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 SET3YKR029C 2256 nt0.72□□□□□ -2.29
MCP1Q12106 CLU1YMR012W 3834 nt0.71□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 COG4YPR105C 2586 nt0.71□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 RIM20YOR275C 1986 nt0.71□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YDL016CYDL016C 303 nt0.71□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 MET32YDR253C 576 nt0.71□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.71□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 HUG1YML058W-A 207 nt0.71□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 SNU56YDR240C 1479 nt0.71□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YLL032CYLL032C 2478 nt0.7□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 APQ13YJL075C 417 nt0.7□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 UPS1YLR193C 528 nt0.7□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 STO1YMR125W 2586 nt0.7□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 HUR1YGL168W 333 nt0.69□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YGR025WYGR025W 303 nt0.69□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YKL123WYKL123W 381 nt0.69□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YOR029WYOR029W 336 nt0.69□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 snR13snR13 124 nt0.69□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 TSC3YBR058C-A 243 nt0.69□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YDL206WYDL206W 2289 nt0.69□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 RFX1YLR176C 2436 nt0.68□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 NHP2YDL208W 471 nt0.68□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YDR029WYDR029W 315 nt0.68□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.68□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YDR521WYDR521W 336 nt0.68□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 MXR1YER042W 555 nt0.68□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 MRPL31YKL138C 396 nt0.68□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 RPL32YBL092W 393 nt0.68□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 MMS4YBR098W 2076 nt0.68□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 SLY1YDR189W 2001 nt0.67□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 PDE2YOR360C 1581 nt0.67□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.67□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YGL239CYGL239C 315 nt0.67□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.67□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 CMC4YMR194C-B 222 nt0.67□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 LCD1YDR499W 2244 nt0.66□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YAP3YHL009C 993 nt0.66□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 NBL1YHR199C-A 222 nt0.66□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 YIL059CYIL059C 366 nt0.66□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 RCN2YOR220W 798 nt0.66□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 NUP157YER105C 4176 nt0.66□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 ENV11YGR071C 2583 nt0.66□□□□□ -2.3
MCP1Q12106 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.65□□□□□ -2.31
MCP1Q12106 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.65□□□□□ -2.31
MCP1Q12106 YDR269CYDR269C 324 nt0.65□□□□□ -2.31
MCP1Q12106 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.65□□□□□ -2.31
MCP1Q12106 YER135CYER135C 393 nt0.65□□□□□ -2.31
MCP1Q12106 RRT1YBL048W 312 nt0.65□□□□□ -2.31
MCP1Q12106 YOR199WYOR199W 330 nt0.65□□□□□ -2.31
MCP1Q12106 SLD3YGL113W 2007 nt0.64□□□□□ -2.31
MCP1Q12106 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.64□□□□□ -2.31
MCP1Q12106 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79 ms