Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 YBL071CYBL071C 309 nt1.23□□□□□ -2.21
VIK1Q12045 YPL068CYPL068C 882 nt1.23□□□□□ -2.21
VIK1Q12045 DGR2YKL121W 2559 nt1.23□□□□□ -2.21
VIK1Q12045 GUP1YGL084C 1683 nt1.23□□□□□ -2.21
VIK1Q12045 HIT1YJR055W 495 nt1.22□□□□□ -2.21
VIK1Q12045 RPL40BYKR094C 387 nt1.22□□□□□ -2.21
VIK1Q12045 YLR287CYLR287C 1068 nt1.22□□□□□ -2.21
VIK1Q12045 RPL33BYOR234C 324 nt1.22□□□□□ -2.21
VIK1Q12045 NUP192YJL039C 5052 nt1.22□□□□□ -2.21
VIK1Q12045 SMC4YLR086W 4257 nt1.21□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 CBS1YDL069C 690 nt1.21□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 EMC5YIL027C 426 nt1.21□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.21□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YPL182CYPL182C 384 nt1.21□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 LYS14YDR034C 2373 nt1.21□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 PAU2YEL049W 363 nt1.2□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YEL057CYEL057C 702 nt1.2□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 RTT102YGR275W 474 nt1.2□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.2□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YLR255CYLR255C 354 nt1.2□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 MVP1YMR004W 1536 nt1.2□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 PRE4YFR050C 801 nt1.19□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 RPL34BYIL052C 366 nt1.19□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YJL007CYJL007C 315 nt1.19□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.19□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YSY6YBR162W-A 198 nt1.19□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 UFD2YDL190C 2886 nt1.19□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 LAA1YJL207C 6045 nt1.19□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 VAM6YDL077C 3150 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YJR029WYJR029W 5268 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 DIE2YGR227W 1578 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 RTR1YER139C 681 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 ENV11YGR071C 2583 nt1.18□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YDL011CYDL011C 324 nt1.17□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 MRPL50YNR022C 420 nt1.17□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YPL205CYPL205C 345 nt1.17□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 ZIP1YDR285W 2628 nt1.17□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 SDH7YDR511W 402 nt1.16□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YGL217CYGL217C 342 nt1.16□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 VPS20YMR077C 666 nt1.16□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 HCH1YNL281W 462 nt1.16□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt1.16□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YOR376WYOR376W 369 nt1.16□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 GDS1YOR355W 1569 nt1.16□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 DCP2YNL118C 2913 nt1.16□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 ROM2YLR371W 4071 nt1.15□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 NUP188YML103C 4968 nt1.15□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 PIG1YLR273C 1947 nt1.15□□□□□ -2.22
VIK1Q12045 YDR114CYDR114C 303 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 TIM13YGR181W 318 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YHL037CYHL037C 402 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YJR157WYJR157W 363 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 TIM18YOR297C 579 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 RAD50YNL250W 3939 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 MSH3YCR092C 3057 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 NUT1YGL151W 3399 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 KIP1YBL063W 3336 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 SLX4YLR135W 2247 nt1.15□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 RFX1YLR176C 2436 nt1.14□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 CYC7YEL039C 342 nt1.14□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 snR14snR14 160 nt1.14□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YLL032CYLL032C 2478 nt1.14□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 APL1YJR005W 2103 nt1.13□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.13□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 RPS24BYIL069C 408 nt1.13□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.13□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YCS4YLR272C 3531 nt1.12□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 SGO1YOR073W 1773 nt1.12□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YDR269CYDR269C 324 nt1.12□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 MRPL31YKL138C 396 nt1.12□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 PRM3YPL192C 402 nt1.12□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 NUT2YPR168W 474 nt1.12□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 SWI6YLR182W 2412 nt1.11□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 CLU1YMR012W 3834 nt1.11□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YDL211CYDL211C 1119 nt1.11□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YAP6YDR259C 1152 nt1.11□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YIL059CYIL059C 366 nt1.11□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 RPL26AYLR344W 384 nt1.11□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.1□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 RPS27AYKL156W 249 nt1.1□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.1□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 SEC5YDR166C 2916 nt1.1□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 SPT7YBR081C 3999 nt1.1□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 MUK1YPL070W 1839 nt1.1□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 VPS54YDR027C 2670 nt1.1□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 APL2YKL135C 2181 nt1.1□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 AZF1YOR113W 2745 nt1.09□□□□□ -2.23
VIK1Q12045 SPO75YLL005C 2607 nt1.08□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 SDH2YLL041C 801 nt1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.2 ms