Protein–RNA interactions for Protein: Q06333

CNL1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit CNL1, yeastyeast

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CNL1Q06333 snR59snR59 78 nt0.05□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 TAD1YGL243W 1203 nt0.05□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 INA22YIR024C 651 nt0.05□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 ULP2YIL031W 3105 nt0.04□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 SPO23YBR250W 1572 nt0.04□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 PMP1YCR024C-A 123 nt0.04□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 snR79snR79 84 nt0.04□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.04□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 AFR1YDR085C 1863 nt0.03□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 ESP1YGR098C 4893 nt0.03□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 UBX4YMR067C 1251 nt0.03□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 RRT1YBL048W 312 nt0.03□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.03□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 ENV11YGR071C 2583 nt0.03□□□□□ -2.4
CNL1Q06333 COX7YMR256C 183 nt0.02□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.02□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 LOA1YPR139C 903 nt0.02□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 NOP9YJL010C 2001 nt0.02□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 YDR115WYDR115W 318 nt0□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 IQG1YPL242C 4488 nt-0.01□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 RPL9AYGL147C 576 nt-0.01□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 ANS1YHR126C 480 nt-0.01□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 COX12YLR038C 252 nt-0.01□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.01□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 APL2YKL135C 2181 nt-0.01□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 snR84snR84 550 nt-0.02□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.02□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.02□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 RPL26AYLR344W 384 nt-0.02□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 YOR364WYOR364W 369 nt-0.02□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 YDR008CYDR008C 351 nt-0.03□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 QCR7YDR529C 384 nt-0.03□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 PAN3YKL025C 2040 nt-0.03□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 YJR003CYJR003C 1560 nt-0.03□□□□□ -2.41
CNL1Q06333 PET111YMR257C 2403 nt-0.04□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.04□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.04□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YPR099CYPR099C 357 nt-0.04□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.05□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YGR290WYGR290W 444 nt-0.05□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 SPO11YHL022C 1197 nt-0.05□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YHL042WYHL042W 453 nt-0.05□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.05□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YLR252WYLR252W 306 nt-0.05□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 RPL32YBL092W 393 nt-0.05□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YOL106WYOL106W 354 nt-0.05□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YBR071WYBR071W 636 nt-0.05□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.06□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.06□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 ACF4YJR083C 930 nt-0.06□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 MLP1YKR095W 5628 nt-0.06□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 MLP2YIL149C 5040 nt-0.07□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 RSM27YGR215W 333 nt-0.07□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.07□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 UBC7YMR022W 498 nt-0.07□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.07□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 VIK1YPL253C 1944 nt-0.08□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 TDA2YER071C 381 nt-0.08□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 BIG1YHR101C 1008 nt-0.08□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 COX3Q0275 810 nt-0.08□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YOR053WYOR053W 342 nt-0.08□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 COG4YPR105C 2586 nt-0.08□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 BIR1YJR089W 2865 nt-0.09□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YDL032WYDL032W 312 nt-0.09□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 NPC2YDL046W 522 nt-0.09□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 SRB7YDR308C 423 nt-0.09□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YDR344CYDR344C 444 nt-0.09□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 RCN2YOR220W 798 nt-0.09□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.09□□□□□ -2.42
CNL1Q06333 LOC1YFR001W 615 nt-0.1□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YFR057WYFR057W 456 nt-0.1□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 VMA21YGR105W 234 nt-0.1□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.1□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 FYV10YIL097W 1551 nt-0.11□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 SEC8YPR055W 3198 nt-0.11□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt-0.11□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 BSC3YLR465C 309 nt-0.11□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 CSM4YPL200W 471 nt-0.11□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0.11□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 PRP5YBR237W 2550 nt-0.12□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 GPG1YGL121C 381 nt-0.12□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YKL111CYKL111C 336 nt-0.12□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 MRPL31YKL138C 396 nt-0.12□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 RRI2YOL117W 1938 nt-0.13□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.13□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 LRP1YHR081W 555 nt-0.13□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.13□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 TFB6YOR352W 1032 nt-0.13□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YPL197CYPL197C 414 nt-0.13□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 snR190snR190 190 nt-0.13□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 AI1Q0050 2505 nt-0.13□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 CDC33YOL139C 642 nt-0.14□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 COG8YML071C 1824 nt-0.15□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 HTB1YDR224C 396 nt-0.15□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.15□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 snR13snR13 124 nt-0.15□□□□□ -2.43
CNL1Q06333 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.16□□□□□ -2.44
CNL1Q06333 LIN1YHR156C 1023 nt-0.16□□□□□ -2.44
CNL1Q06333 PKH2YOL100W 3246 nt-0.16□□□□□ -2.44
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