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Protein–RNA interactions for Protein: Q03048
COF1, Cofilin, yeast
Known RBP
Predictions only
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143 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COF1
Q03048
YPR147C
YPR147C
915 nt
0.2
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
SPO23
YBR250W
1572 nt
0.19
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
UPS1
YLR193C
528 nt
0.19
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YOL106W
YOL106W
354 nt
0.19
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
CHS6
YJL099W
2241 nt
0.19
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
HTB1
YDR224C
396 nt
0.18
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
MET32
YDR253C
576 nt
0.18
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YIL134C-A
YIL134C-A
204 nt
0.18
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YJR140W-A
YJR140W-A
150 nt
0.18
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YOR218C
YOR218C
420 nt
0.18
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YDR182W-A
YDR182W-A
204 nt
0.17
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YEL030C-A
YEL030C-A
315 nt
0.17
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YOR282W
YOR282W
321 nt
0.17
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
FMP27
YLR454W
7887 nt
0.17
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
QCR7
YDR529C
384 nt
0.16
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
YGR042W
YGR042W
816 nt
0.16
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
RRT1
YBL048W
312 nt
0.16
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
ENV11
YGR071C
2583 nt
0.16
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
SLI15
YBR156C
2097 nt
0.15
□□□□□ -2.38
COF1
Q03048
RRI2
YOL117W
1938 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
snR84
snR84
550 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
SBH1
YER087C-B
249 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YER158W-A
YER158W-A
216 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
PAU12
YGR294W
363 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YHR054C
YHR054C
1065 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
RPS24B
YIL069C
408 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YPR099C
YPR099C
357 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
NPR2
YEL062W
1848 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
PAN3
YKL025C
2040 nt
0.14
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
BEM3
YPL115C
3387 nt
0.14
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YDR008C
YDR008C
351 nt
0.14
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YMR153C-A
YMR153C-A
336 nt
0.14
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YMR304C-A
YMR304C-A
351 nt
0.14
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YBR071W
YBR071W
636 nt
0.14
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
PMP1
YCR024C-A
123 nt
0.13
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
RPL26B
YGR034W
384 nt
0.13
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
UBX4
YMR067C
1251 nt
0.13
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YBR121C-A
YBR121C-A
159 nt
0.13
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
COG4
YPR105C
2586 nt
0.12
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
POL32
YJR043C
1053 nt
0.12
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YKL111C
YKL111C
336 nt
0.12
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YEL018C-A
YEL018C-A
534 nt
0.11
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
RPL9A
YGL147C
576 nt
0.11
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
LRP1
YHR081W
555 nt
0.11
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
0.11
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YPL197C
YPL197C
414 nt
0.11
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YJR003C
YJR003C
1560 nt
0.11
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
NOP9
YJL010C
2001 nt
0.1
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
TAD1
YGL243W
1203 nt
0.1
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YNL150W
YNL150W
408 nt
0.1
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
TRS65
YGR166W
1683 nt
0.1
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
YLL032C
YLL032C
2478 nt
0.09
□□□□□ -2.39
COF1
Q03048
RSM27
YGR215W
333 nt
0.09
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
LIN1
YHR156C
1023 nt
0.09
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.09
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
RPS30B
YOR182C
192 nt
0.09
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YCK3
YER123W
1575 nt
0.09
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
PPN1
YDR452W
2025 nt
0.09
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YDR220C
YDR220C
294 nt
0.08
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
RPL26A
YLR344W
384 nt
0.08
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
ULP2
YIL031W
3105 nt
0.07
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
TIM10
YHR005C-A
282 nt
0.07
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
RPC10
YHR143W-A
213 nt
0.07
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
RPL32
YBL092W
393 nt
0.07
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
IPI3
YNL182C
1668 nt
0.07
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
NPC2
YDL046W
522 nt
0.06
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YDR344C
YDR344C
444 nt
0.06
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YMR013C-A
YMR013C-A
150 nt
0.06
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YNL146C-A
YNL146C-A
195 nt
0.06
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.06
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
AI1
Q0050
2505 nt
0.06
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
UTP20
YBL004W
7482 nt
0.05
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
SPO11
YHL022C
1197 nt
0.05
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YHL042W
YHL042W
453 nt
0.05
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YLR146W-A
YLR146W-A
189 nt
0.05
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YLR252W
YLR252W
306 nt
0.05
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
LOA1
YPR139C
903 nt
0.05
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
RSM23
YGL129C
1353 nt
0.05
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
0.05
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
CUP1-1
YHR053C
186 nt
0.04
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
CUP1-2
YHR055C
186 nt
0.04
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
MRPL31
YKL138C
396 nt
0.04
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
AFR1
YDR085C
1863 nt
0.03
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
PET111
YMR257C
2403 nt
0.03
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
YFR057W
YFR057W
456 nt
0.03
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
TFB6
YOR352W
1032 nt
0.03
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
MLP1
YKR095W
5628 nt
0.03
□□□□□ -2.4
COF1
Q03048
BI4
Q0120
1917 nt
0.03
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
MLP2
YIL149C
5040 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
WIP1
YDR374W-A
270 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
GPG1
YGL121C
381 nt
0.02
□□□□□ -2.41
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