Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms