Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT2P53127 NUT1YGL151W 3399 nt0.34□□□□□ -2.35
SNT2P53127 HDA3YPR179C 1968 nt0.34□□□□□ -2.35
SNT2P53127 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.34□□□□□ -2.36
SNT2P53127 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.34□□□□□ -2.36
SNT2P53127 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.34□□□□□ -2.36
SNT2P53127 YPL080CYPL080C 327 nt0.34□□□□□ -2.36
SNT2P53127 TAD1YGL243W 1203 nt0.33□□□□□ -2.36
SNT2P53127 DFG10YIL049W 762 nt0.33□□□□□ -2.36
SNT2P53127 PIG1YLR273C 1947 nt0.33□□□□□ -2.36
SNT2P53127 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.32□□□□□ -2.36
SNT2P53127 GIM5YML094W 492 nt0.32□□□□□ -2.36
SNT2P53127 YOR199WYOR199W 330 nt0.32□□□□□ -2.36
SNT2P53127 ATP20YPR020W 348 nt0.32□□□□□ -2.36
SNT2P53127 ZIP1YDR285W 2628 nt0.32□□□□□ -2.36
SNT2P53127 SAG1YJR004C 1953 nt0.32□□□□□ -2.36
SNT2P53127 SWI5YDR146C 2130 nt0.32□□□□□ -2.36
SNT2P53127 GLG1YKR058W 1851 nt0.32□□□□□ -2.36
SNT2P53127 ALG13YGL047W 609 nt0.31□□□□□ -2.36
SNT2P53127 RUF22RUF22 515 nt0.31□□□□□ -2.36
SNT2P53127 snR45snR45 172 nt0.31□□□□□ -2.36
SNT2P53127 ARV1YLR242C 966 nt0.3□□□□□ -2.36
SNT2P53127 YOP1YPR028W 543 nt0.3□□□□□ -2.36
SNT2P53127 snR59snR59 78 nt0.3□□□□□ -2.36
SNT2P53127 YDR509WYDR509W 348 nt0.3□□□□□ -2.36
SNT2P53127 RPL22BYFL034C-A 369 nt0.3□□□□□ -2.36
SNT2P53127 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.3□□□□□ -2.36
SNT2P53127 SLM6YBR266C 453 nt0.3□□□□□ -2.36
SNT2P53127 SCW11YGL028C 1629 nt0.29□□□□□ -2.36
SNT2P53127 SLD3YGL113W 2007 nt0.29□□□□□ -2.36
SNT2P53127 HNT1YDL125C 477 nt0.29□□□□□ -2.36
SNT2P53127 DAD1YDR016C 285 nt0.29□□□□□ -2.36
SNT2P53127 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.29□□□□□ -2.36
SNT2P53127 ABF2YMR072W 552 nt0.29□□□□□ -2.36
SNT2P53127 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.29□□□□□ -2.36
SNT2P53127 PDE2YOR360C 1581 nt0.28□□□□□ -2.36
SNT2P53127 DBP6YNR038W 1890 nt0.28□□□□□ -2.36
SNT2P53127 CMS1YLR003C 876 nt0.28□□□□□ -2.37
SNT2P53127 RPL37AYLR185W 267 nt0.28□□□□□ -2.37
SNT2P53127 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.27□□□□□ -2.37
SNT2P53127 RPL32YBL092W 393 nt0.27□□□□□ -2.37
SNT2P53127 SPR2YOR214C 711 nt0.27□□□□□ -2.37
SNT2P53127 MKT1YNL085W 2493 nt0.26□□□□□ -2.37
SNT2P53127 VPS52YDR484W 1926 nt0.26□□□□□ -2.37
SNT2P53127 OCA6YDR067C 675 nt0.26□□□□□ -2.37
SNT2P53127 IRC2YDR112W 309 nt0.26□□□□□ -2.37
SNT2P53127 snR79snR79 84 nt0.25□□□□□ -2.37
SNT2P53127 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.25□□□□□ -2.37
SNT2P53127 SDH2YLL041C 801 nt0.25□□□□□ -2.37
SNT2P53127 GMC2YLR445W 567 nt0.25□□□□□ -2.37
SNT2P53127 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt0.24□□□□□ -2.37
SNT2P53127 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.24□□□□□ -2.37
SNT2P53127 RSM27YGR215W 333 nt0.23□□□□□ -2.37
SNT2P53127 SPC2YML055W 537 nt0.23□□□□□ -2.37
SNT2P53127 KAR1YNL188W 1302 nt0.23□□□□□ -2.37
SNT2P53127 SRB7YDR308C 423 nt0.22□□□□□ -2.37
SNT2P53127 LOC1YFR001W 615 nt0.22□□□□□ -2.37
SNT2P53127 YOL106WYOL106W 354 nt0.22□□□□□ -2.37
SNT2P53127 snR13snR13 124 nt0.22□□□□□ -2.37
SNT2P53127 BFR2YDR299W 1605 nt0.22□□□□□ -2.37
SNT2P53127 TDA2YER071C 381 nt0.21□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.21□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YPR170CYPR170C 336 nt0.21□□□□□ -2.38
SNT2P53127 MMS4YBR098W 2076 nt0.21□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YDL152WYDL152W 366 nt0.21□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YAR053WYAR053W 297 nt0.21□□□□□ -2.38
SNT2P53127 COX7YMR256C 183 nt0.21□□□□□ -2.38
SNT2P53127 LCD1YDR499W 2244 nt0.21□□□□□ -2.38
SNT2P53127 MET32YDR253C 576 nt0.2□□□□□ -2.38
SNT2P53127 ISD11YER048W-A 285 nt0.2□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YGR042WYGR042W 816 nt0.2□□□□□ -2.38
SNT2P53127 COX3Q0275 810 nt0.2□□□□□ -2.38
SNT2P53127 ACF4YJR083C 930 nt0.2□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.19□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YDR114CYDR114C 303 nt0.19□□□□□ -2.38
SNT2P53127 RRI2YOL117W 1938 nt0.18□□□□□ -2.38
SNT2P53127 snR84snR84 550 nt0.18□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.18□□□□□ -2.38
SNT2P53127 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.18□□□□□ -2.38
SNT2P53127 RPS24BYIL069C 408 nt0.18□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.18□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YPR153WYPR153W 423 nt0.18□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.17□□□□□ -2.38
SNT2P53127 HTB1YDR224C 396 nt0.17□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YJL007CYJL007C 315 nt0.17□□□□□ -2.38
SNT2P53127 POL32YJR043C 1053 nt0.17□□□□□ -2.38
SNT2P53127 UPS1YLR193C 528 nt0.17□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YOR364WYOR364W 369 nt0.17□□□□□ -2.38
SNT2P53127 SPO23YBR250W 1572 nt0.17□□□□□ -2.38
SNT2P53127 RRT1YBL048W 312 nt0.16□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YPR099CYPR099C 357 nt0.16□□□□□ -2.38
SNT2P53127 CHS6YJL099W 2241 nt0.16□□□□□ -2.38
SNT2P53127 PAN3YKL025C 2040 nt0.16□□□□□ -2.38
SNT2P53127 SLI15YBR156C 2097 nt0.15□□□□□ -2.38
SNT2P53127 YOR282WYOR282W 321 nt0.15□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.15□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.15□□□□□ -2.39
SNT2P53127 NPR2YEL062W 1848 nt0.15□□□□□ -2.39
SNT2P53127 RSM23YGL129C 1353 nt0.15□□□□□ -2.39
SNT2P53127 QCR7YDR529C 384 nt0.14□□□□□ -2.39
SNT2P53127 RPL26BYGR034W 384 nt0.14□□□□□ -2.39
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