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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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317 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
MVP1
YMR004W
1536 nt
2.46
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
STE11
YLR362W
2154 nt
2.46
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
SPF1
YEL031W
3648 nt
2.46
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
ZRG17
YNR039C
1818 nt
2.45
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
YEL020C-B
YEL020C-B
198 nt
2.45
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
BLI1
YKL061W
342 nt
2.45
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
SDH2
YLL041C
801 nt
2.45
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
TRA1
YHR099W
11235 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
MAK10
YEL053C
2202 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
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YHR071C-A
321 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
PAU18
YLL064C
363 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
JLP2
YMR132C
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□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
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YMR141W-A
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2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
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YNL028W
318 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
PAU6
YNR076W
363 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
YOL155W-A
YOL155W-A
135 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
MSB1
YOR188W
3414 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
SYH1
YPL105C
2550 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
PHO2
YDL106C
1680 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
YPR097W
YPR097W
3222 nt
2.44
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
ZIP1
YDR285W
2628 nt
2.43
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
MRP10
YDL045W-A
288 nt
2.43
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
YMR046W-A
YMR046W-A
129 nt
2.43
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
GIP3
YPL137C
3831 nt
2.43
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
SGS1
YMR190C
4344 nt
2.43
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
MLH1
YMR167W
2310 nt
2.42
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
RAV1
YJR033C
4074 nt
2.42
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
CDC36
YDL165W
576 nt
2.42
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
YDR209C
YDR209C
414 nt
2.42
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
YKR075W-A
YKR075W-A
270 nt
2.42
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
IST2
YBR086C
2841 nt
2.42
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
SIR3
YLR442C
2937 nt
2.41
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
YEF3
YLR249W
3135 nt
2.4
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
MCD1
YDL003W
1701 nt
2.4
□□□□□ -2.02
RTA1
P53047
SEC16
YPL085W
6588 nt
2.4
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
YLL032C
YLL032C
2478 nt
2.4
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
RPL37B
YDR500C
267 nt
2.4
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
KTI11
YBL071W-A
249 nt
2.4
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
YNL337W
YNL337W
255 nt
2.4
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
snR55
snR55
98 nt
2.39
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
YER088C-A
YER088C-A
324 nt
2.39
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
ABF2
YMR072W
552 nt
2.39
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
CSE2
YNR010W
450 nt
2.39
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
YCL046W
YCL046W
324 nt
2.39
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
SPT21
YMR179W
2277 nt
2.39
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
UBP1
YDL122W
2430 nt
2.39
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
CTR9
YOL145C
3234 nt
2.38
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
YMR230W-A
YMR230W-A
189 nt
2.38
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
SAS3
YBL052C
2496 nt
2.38
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
YBR064W
YBR064W
429 nt
2.38
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
NOP14
YDL148C
2433 nt
2.38
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
HMI1
YOL095C
2121 nt
2.38
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
SSS1
YDR086C
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2.37
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
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YJL135W
318 nt
2.37
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
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YMR194C-A
225 nt
2.37
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
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YOR108C-A
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2.37
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
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YHR079C
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RTA1
P53047
VIK1
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RTA1
P53047
NUP170
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2.36
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RTA1
P53047
snR72
snR72
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2.36
□□□□□ -2.03
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P53047
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YDR003W-A
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2.36
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RTA1
P53047
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YDR406W-A
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RTA1
P53047
SIR4
YDR227W
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2.36
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
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YCR087C-A
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2.35
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
snR80
snR80
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2.35
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
YOL160W
YOL160W
342 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
TDA9
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3756 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
HER1
YOR227W
3741 nt
2.34
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
SCP160
YJL080C
3669 nt
2.34
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
NAB6
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2.34
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
IRA2
YOL081W
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2.34
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
BUD2
YKL092C
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2.34
□□□□□ -2.03
RTA1
P53047
YOL098C
YOL098C
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□□□□□ -2.04
RTA1
P53047
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YDL092W
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□□□□□ -2.04
RTA1
P53047
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YJL197C-A
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YBL012C
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P53047
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YMR172C-A
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P53047
CAT2
YML042W
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2.32
□□□□□ -2.04
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P53047
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□□□□□ -2.04
RTA1
P53047
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YPL174C
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2.32
□□□□□ -2.04
RTA1
P53047
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YFR016C
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□□□□□ -2.04
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P53047
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YOL076W
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P53047
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YJL098W
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P53047
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P53047
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YGL041C
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YGL052W
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P53047
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YMR242W-A
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P53047
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P53047
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RTA1
P53047
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□□□□□ -2.04
RTA1
P53047
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2.29
□□□□□ -2.04
RTA1
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□□□□□ -2.04
RTA1
P53047
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P53047
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□□□□□ -2.04
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□□□□□ -2.04
RTA1
P53047
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YOR354C
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□□□□□ -2.04
RTA1
P53047
DGR2
YKL121W
2559 nt
2.28
□□□□□ -2.04
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