Protein–RNA interactions for Protein: P40058

YER085C, Uncharacterized protein YER085C, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER085CP40058 FIG4YNL325C 2640 nt0.8□□□□□ -2.28
YER085CP40058 VMA21YGR105W 234 nt0.79□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YAP3YHL009C 993 nt0.79□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YIL029CYIL029C 429 nt0.79□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.79□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YOR199WYOR199W 330 nt0.79□□□□□ -2.28
YER085CP40058 STO1YMR125W 2586 nt0.78□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.78□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SHE9YDR393W 1371 nt0.78□□□□□ -2.28
YER085CP40058 PDE2YOR360C 1581 nt0.78□□□□□ -2.29
YER085CP40058 ALY2YJL084C 3141 nt0.77□□□□□ -2.29
YER085CP40058 MMS4YBR098W 2076 nt0.77□□□□□ -2.29
YER085CP40058 PXA2YKL188C 2562 nt0.77□□□□□ -2.29
YER085CP40058 BUD3YCL014W 4911 nt0.76□□□□□ -2.29
YER085CP40058 Q0255Q0255 1419 nt0.76□□□□□ -2.29
YER085CP40058 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.76□□□□□ -2.29
YER085CP40058 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.76□□□□□ -2.29
YER085CP40058 UPS1YLR193C 528 nt0.76□□□□□ -2.29
YER085CP40058 YPR039WYPR039W 336 nt0.76□□□□□ -2.29
YER085CP40058 LAA1YJL207C 6045 nt0.76□□□□□ -2.29
YER085CP40058 TTI1YKL033W 3117 nt0.76□□□□□ -2.29
YER085CP40058 SLY1YDR189W 2001 nt0.76□□□□□ -2.29
YER085CP40058 ILM1YJR118C 612 nt0.75□□□□□ -2.29
YER085CP40058 APL2YKL135C 2181 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 REV3YPL167C 4515 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 BEM2YER155C 6504 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 SIP4YJL089W 2490 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 MXR1YER042W 555 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 NBL1YHR199C-A 222 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 TMA22YJR014W 597 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 YNL050CYNL050C 813 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 ERP4YOR016C 624 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 ENV11YGR071C 2583 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 YLL032CYLL032C 2478 nt0.74□□□□□ -2.29
YER085CP40058 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.73□□□□□ -2.29
YER085CP40058 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.73□□□□□ -2.29
YER085CP40058 YIL059CYIL059C 366 nt0.73□□□□□ -2.29
YER085CP40058 LCD1YDR499W 2244 nt0.73□□□□□ -2.29
YER085CP40058 YDL196WYDL196W 330 nt0.72□□□□□ -2.29
YER085CP40058 APQ13YJL075C 417 nt0.72□□□□□ -2.29
YER085CP40058 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.72□□□□□ -2.29
YER085CP40058 IRC16YPR038W 360 nt0.72□□□□□ -2.29
YER085CP40058 SPO75YLL005C 2607 nt0.71□□□□□ -2.3
YER085CP40058 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.71□□□□□ -2.3
YER085CP40058 RRT1YBL048W 312 nt0.71□□□□□ -2.3
YER085CP40058 SLD3YGL113W 2007 nt0.71□□□□□ -2.3
YER085CP40058 RFX1YLR176C 2436 nt0.7□□□□□ -2.3
YER085CP40058 OCA6YDR067C 675 nt0.7□□□□□ -2.3
YER085CP40058 YKL044WYKL044W 321 nt0.7□□□□□ -2.3
YER085CP40058 MRPL31YKL138C 396 nt0.7□□□□□ -2.3
YER085CP40058 HCH1YNL281W 462 nt0.7□□□□□ -2.3
YER085CP40058 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.7□□□□□ -2.3
YER085CP40058 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.69□□□□□ -2.3
YER085CP40058 BER1YLR412W 825 nt0.69□□□□□ -2.3
YER085CP40058 RCN2YOR220W 798 nt0.69□□□□□ -2.3
YER085CP40058 SLI15YBR156C 2097 nt0.69□□□□□ -2.3
YER085CP40058 YDL073WYDL073W 2955 nt0.68□□□□□ -2.3
YER085CP40058 MSH3YCR092C 3057 nt0.68□□□□□ -2.3
YER085CP40058 WAR1YML076C 2835 nt0.67□□□□□ -2.3
YER085CP40058 SWF1YDR126W 1011 nt0.67□□□□□ -2.3
YER085CP40058 ALG13YGL047W 609 nt0.67□□□□□ -2.3
YER085CP40058 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.67□□□□□ -2.3
YER085CP40058 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.67□□□□□ -2.3
YER085CP40058 RPL32YBL092W 393 nt0.67□□□□□ -2.3
YER085CP40058 YPR153WYPR153W 423 nt0.67□□□□□ -2.3
YER085CP40058 YML003WYML003W 873 nt0.66□□□□□ -2.3
YER085CP40058 IES4YOR189W 351 nt0.66□□□□□ -2.3
YER085CP40058 SVS1YPL163C 783 nt0.66□□□□□ -2.3
YER085CP40058 DOP1YDR141C 5097 nt0.65□□□□□ -2.31
YER085CP40058 NPC2YDL046W 522 nt0.65□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YDR269CYDR269C 324 nt0.65□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YGL239CYGL239C 315 nt0.65□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.65□□□□□ -2.31
YER085CP40058 PAU24YBR301W 363 nt0.65□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.64□□□□□ -2.31
YER085CP40058 DBP6YNR038W 1890 nt0.64□□□□□ -2.31
YER085CP40058 MET32YDR253C 576 nt0.63□□□□□ -2.31
YER085CP40058 ISD11YER048W-A 285 nt0.63□□□□□ -2.31
YER085CP40058 ANS1YHR126C 480 nt0.63□□□□□ -2.31
YER085CP40058 SEC1YDR164C 2175 nt0.63□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.61□□□□□ -2.31
YER085CP40058 HUR1YGL168W 333 nt0.61□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.61□□□□□ -2.31
YER085CP40058 snR13snR13 124 nt0.61□□□□□ -2.31
YER085CP40058 RKR1YMR247C 4689 nt0.61□□□□□ -2.31
YER085CP40058 COG4YPR105C 2586 nt0.6□□□□□ -2.31
YER085CP40058 PAN2YGL094C 3348 nt0.6□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YDL016CYDL016C 303 nt0.6□□□□□ -2.31
YER085CP40058 PHS1YJL097W 654 nt0.6□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YJR141WYJR141W 1044 nt0.6□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YAR009CYAR009C 3591 nt0.6□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YJR003CYJR003C 1560 nt0.6□□□□□ -2.31
YER085CP40058 ZIP2YGL249W 2115 nt0.59□□□□□ -2.31
YER085CP40058 EFR3YMR212C 2349 nt0.59□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YGR025WYGR025W 303 nt0.59□□□□□ -2.31
YER085CP40058 RTT102YGR275W 474 nt0.59□□□□□ -2.31
YER085CP40058 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.59□□□□□ -2.31
YER085CP40058 PRP16YKR086W 3216 nt0.59□□□□□ -2.32
YER085CP40058 YER135CYER135C 393 nt0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.7 ms