Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSO14618 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCSO14618 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCSO14618 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSO14618 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSO14618 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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