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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
LEE1
YPL054W
906 nt
1.73
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
HIR3
YJR140C
4947 nt
1.73
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
AGC1
YPR021C
2709 nt
1.73
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YJR039W
YJR039W
3366 nt
1.73
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
HSH155
YMR288W
2916 nt
1.73
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
BPH1
YCR032W
6504 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
MSC6
YOR354C
2079 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YDL011C
YDL011C
324 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YDR008C
YDR008C
351 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YDR269C
YDR269C
324 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YHR028W-A
YHR028W-A
321 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
TMA10
YLR327C
261 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
TDA9
YML081W
3756 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
IRE1
YHR079C
3348 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
VPS15
YBR097W
4365 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
CTR9
YOL145C
3234 nt
1.72
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
SSQ1
YLR369W
1974 nt
1.71
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YHR210C
YHR210C
1026 nt
1.71
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
RPL32
YBL092W
393 nt
1.71
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YBR285W
YBR285W
435 nt
1.71
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YNL144C
YNL144C
2223 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
WIP1
YDR374W-A
270 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YHR138C
YHR138C
345 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
ABM1
YJR108W
372 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
MCM22
YJR135C
720 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
PAU18
YLL064C
363 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
PAU6
YNR076W
363 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YBL108W
YBL108W
306 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YOR053W
YOR053W
342 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
SEC31
YDL195W
3822 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
PEX8
YGR077C
1770 nt
1.7
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
SPO23
YBR250W
1572 nt
1.69
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
HDA3
YPR179C
1968 nt
1.69
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
VPS34
YLR240W
2628 nt
1.69
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
PAU3
YCR104W
375 nt
1.69
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YDR157W
YDR157W
402 nt
1.69
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YER172C-A
YER172C-A
381 nt
1.69
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
TIM13
YGR181W
318 nt
1.69
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YLR434C
YLR434C
384 nt
1.69
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
SWI5
YDR146C
2130 nt
1.69
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YGR265W
YGR265W
411 nt
1.68
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
RPS27A
YKL156W
249 nt
1.68
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YAR047C
YAR047C
321 nt
1.68
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
RPL9B
YNL067W
576 nt
1.68
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YCL046W
YCL046W
324 nt
1.68
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
MSH6
YDR097C
3729 nt
1.68
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
RLM1
YPL089C
2031 nt
1.67
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
GUP1
YGL084C
1683 nt
1.67
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
OSH6
YKR003W
1347 nt
1.67
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
EMP24
YGL200C
612 nt
1.67
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
PHS1
YJL097W
654 nt
1.67
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YLR146W-A
YLR146W-A
189 nt
1.67
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
NOP53
YPL146C
1368 nt
1.67
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
FAB1
YFR019W
6837 nt
1.66
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
ZRG17
YNR039C
1818 nt
1.66
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
MAK10
YEL053C
2202 nt
1.66
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
BSC3
YLR465C
309 nt
1.66
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
GYP5
YPL249C
2685 nt
1.66
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
TBS1
YBR150C
3285 nt
1.66
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
YLR035C-A
YLR035C-A
3468 nt
1.66
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
FIG2
YCR089W
4830 nt
1.65
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
FRK1
YPL141C
2598 nt
1.65
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
MDM20
YOL076W
2391 nt
1.65
□□□□□ -2.14
VAM3
Q12241
MSH5
YDL154W
2706 nt
1.65
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YJL020W-A
YJL020W-A
258 nt
1.65
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
HHT1
YBR010W
411 nt
1.65
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YOR293C-A
YOR293C-A
150 nt
1.65
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
PEP1
YBL017C
4740 nt
1.65
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YAL068W-A
YAL068W-A
255 nt
1.64
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
AIM9
YER080W
1884 nt
1.64
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
HMI1
YOL095C
2121 nt
1.64
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
PKH3
YDR466W
2697 nt
1.63
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
PXA2
YKL188C
2562 nt
1.63
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
DCP2
YNL118C
2913 nt
1.63
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
PRE4
YFR050C
801 nt
1.63
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
SAR1
YPL218W
573 nt
1.63
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
REV3
YPL167C
4515 nt
1.63
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YDR118W-A
YDR118W-A
117 nt
1.62
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YAP6
YDR259C
1152 nt
1.62
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YML003W
YML003W
873 nt
1.62
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
HCH1
YNL281W
462 nt
1.62
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YPL229W
YPL229W
621 nt
1.62
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
SWI6
YLR182W
2412 nt
1.62
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
PCF11
YDR228C
1881 nt
1.62
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YDR003W-A
YDR003W-A
123 nt
1.61
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
DAD4
YDR320C-A
219 nt
1.61
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
TRX1
YLR043C
312 nt
1.61
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
RPL26A
YLR344W
384 nt
1.61
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
RTP1
YMR185W
2946 nt
1.6
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
RPL31A
YDL075W
342 nt
1.6
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YEL057C
YEL057C
702 nt
1.6
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
RTR1
YER139C
681 nt
1.6
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YKL083W
YKL083W
615 nt
1.6
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
ISF1
YMR081C
1017 nt
1.6
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YOP1
YPR028W
543 nt
1.6
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
UTP21
YLR409C
2820 nt
1.6
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
LYS14
YDR034C
2373 nt
1.59
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
ZIP1
YDR285W
2628 nt
1.59
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
YIL059C
YIL059C
366 nt
1.59
□□□□□ -2.15
VAM3
Q12241
SKI3
YPR189W
4299 nt
1.59
□□□□□ -2.16
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