Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 TIM13YGR181W 318 nt1.93□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 PHS1YJL097W 654 nt1.93□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 RPL32YBL092W 393 nt1.93□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 YPR012WYPR012W 255 nt1.93□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 IRE1YHR079C 3348 nt1.93□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 YNL114CYNL114C 372 nt1.92□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 PCF11YDR228C 1881 nt1.91□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 MCM22YJR135C 720 nt1.91□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 YLR334CYLR334C 381 nt1.91□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 FMP23YBR047W 528 nt1.91□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 BPH1YCR032W 6504 nt1.91□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 SEC31YDL195W 3822 nt1.91□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 CFT2YLR115W 2580 nt1.91□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 GCN2YDR283C 4980 nt1.9□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 PEX8YGR077C 1770 nt1.9□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 GUP1YGL084C 1683 nt1.9□□□□□ -2.1
NMD4Q12129 NEO1YIL048W 3456 nt1.9□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YDR008CYDR008C 351 nt1.9□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.9□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YBL012CYBL012C 402 nt1.9□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YCL046WYCL046W 324 nt1.9□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 SEC63YOR254C 1992 nt1.9□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 DFG16YOR030W 1860 nt1.9□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 SWI5YDR146C 2130 nt1.9□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 VPS34YLR240W 2628 nt1.89□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.89□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.89□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YKL083WYKL083W 615 nt1.89□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YBL073WYBL073W 312 nt1.89□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 HCH1YNL281W 462 nt1.89□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 FAB1YFR019W 6837 nt1.89□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YGR250CYGR250C 2346 nt1.89□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 SEY1YOR165W 2331 nt1.89□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 SAC3YDR159W 3906 nt1.88□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 AIM9YER080W 1884 nt1.88□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YAP6YDR259C 1152 nt1.88□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.88□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 PAU18YLL064C 363 nt1.88□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 TMA7YLR262C-A 195 nt1.88□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 RPL26AYLR344W 384 nt1.88□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 PAU6YNR076W 363 nt1.88□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 CTR9YOL145C 3234 nt1.87□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 SSQ1YLR369W 1974 nt1.87□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 HDA3YPR179C 1968 nt1.87□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 HIR3YJR140C 4947 nt1.87□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 DAD4YDR320C-A 219 nt1.87□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 HSH155YMR288W 2916 nt1.87□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 MSC6YOR354C 2079 nt1.87□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 IRR1YIL026C 3453 nt1.87□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 FRK1YPL141C 2598 nt1.86□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 DCP2YNL118C 2913 nt1.86□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.86□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 SWI6YLR182W 2412 nt1.86□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 AGC1YPR021C 2709 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YJR039WYJR039W 3366 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 snR56snR56 88 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 PAU3YCR104W 375 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 HIT1YJR055W 495 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YML003WYML003W 873 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 ISF1YMR081C 1017 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 HHT1YBR010W 411 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YOR121CYOR121C 306 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YPL229WYPL229W 621 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 OSH6YKR003W 1347 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 MAK10YEL053C 2202 nt1.85□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 RLM1YPL089C 2031 nt1.84□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.84□□□□□ -2.11
NMD4Q12129 ATG11YPR049C 3537 nt1.84□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 HMI1YOL095C 2121 nt1.84□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 UBR2YLR024C 5619 nt1.83□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 ZRG17YNR039C 1818 nt1.83□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YGR265WYGR265W 411 nt1.83□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 ABM1YJR108W 372 nt1.83□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YPL261CYPL261C 309 nt1.83□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 IRC20YLR247C 4671 nt1.83□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 EFR3YMR212C 2349 nt1.82□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 ATG31YDR022C 591 nt1.82□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 PRE4YFR050C 801 nt1.82□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YOR029WYOR029W 336 nt1.82□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 PXA2YKL188C 2562 nt1.82□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 ZIP1YDR285W 2628 nt1.81□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.81□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YIL059CYIL059C 366 nt1.81□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YCL023CYCL023C 348 nt1.81□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 NOP53YPL146C 1368 nt1.81□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 LHS1YKL073W 2646 nt1.8□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.8□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 PEP1YBL017C 4740 nt1.79□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.79□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 ATP6Q0085 780 nt1.79□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 RTR1YER139C 681 nt1.79□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 LYS14YDR034C 2373 nt1.78□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YNL144CYNL144C 2223 nt1.78□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.78□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 YOP1YPR028W 543 nt1.78□□□□□ -2.12
NMD4Q12129 GIM4YEL003W 336 nt1.77□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YEL057CYEL057C 702 nt1.77□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YGR035CYGR035C 351 nt1.77□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.77□□□□□ -2.13
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