Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 SLX4YLR135W 2247 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YCL020WYCL020W 1317 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 snR83snR83 306 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 PRE4YFR050C 801 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YGL015CYGL015C 393 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 RPC10YHR143W-A 213 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YLR366WYLR366W 306 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YBL073WYBL073W 312 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 GRX5YPL059W 453 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SEC3YER008C 4011 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 MAK10YEL053C 2202 nt0.76□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 RAD50YNL250W 3939 nt0.75□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YDL152WYDL152W 366 nt0.75□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SMB1YER029C 591 nt0.75□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SCEIQ0160 708 nt0.75□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.75□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SEC5YDR166C 2916 nt0.75□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 UTP13YLR222C 2454 nt0.75□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 ROM2YLR371W 4071 nt0.74□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 EAF1YDR359C 2949 nt0.74□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 ZRG17YNR039C 1818 nt0.74□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 PAU2YEL049W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YJR087WYJR087W 351 nt0.74□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YKL111CYKL111C 336 nt0.74□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.74□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YNL050CYNL050C 813 nt0.74□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SWI4YER111C 3282 nt0.74□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 STB6YKL072W 2301 nt0.73□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YDL187CYDL187C 330 nt0.73□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 QCR7YDR529C 384 nt0.73□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SPO11YHL022C 1197 nt0.73□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.73□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 ECM9YKR004C 1134 nt0.73□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SWS2YNL081C 432 nt0.73□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 ERP4YOR016C 624 nt0.73□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 HDA3YPR179C 1968 nt0.72□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SNO3YFL060C 669 nt0.72□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YJR079WYJR079W 330 nt0.72□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 HCH1YNL281W 462 nt0.72□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SNO2YNL334C 669 nt0.72□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 SGO1YOR073W 1773 nt0.72□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YLL054CYLL054C 2532 nt0.72□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 VPS54YDR027C 2670 nt0.71□□□□□ -2.29
UPS3Q04006 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.71□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 SRP14YDL092W 441 nt0.71□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.71□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.71□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 APL3YBL037W 3078 nt0.7□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 KAP120YPL125W 3099 nt0.7□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 GDS1YOR355W 1569 nt0.7□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.7□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 RTT102YGR275W 474 nt0.7□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YOP1YPR028W 543 nt0.7□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 CLU1YMR012W 3834 nt0.7□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 NUT1YGL151W 3399 nt0.7□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 AFR1YDR085C 1863 nt0.69□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 TTI1YKL033W 3117 nt0.69□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YDR509WYDR509W 348 nt0.69□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 RPL9BYNL067W 576 nt0.69□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YPR099CYPR099C 357 nt0.69□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.68□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YLR252WYLR252W 306 nt0.68□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 PAU24YBR301W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 SPT21YMR179W 2277 nt0.68□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 SWI5YDR146C 2130 nt0.68□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 PIP2YOR363C 2991 nt0.68□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 Q0255Q0255 1419 nt0.67□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 HNT1YDL125C 477 nt0.67□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.67□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 SLX9YGR081C 633 nt0.67□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 SPO13YHR014W 876 nt0.67□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YOL029CYOL029C 606 nt0.67□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 IRC23YOR044W 474 nt0.67□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 PAN3YKL025C 2040 nt0.67□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 NUP145YGL092W 3954 nt0.66□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 YDR008CYDR008C 351 nt0.66□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 GMC2YLR445W 567 nt0.66□□□□□ -2.3
UPS3Q04006 snR84snR84 550 nt0.65□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 PRP21YJL203W 843 nt0.65□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 NBP1YLR457C 960 nt0.65□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YBR032WYBR032W 303 nt0.65□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 SAS3YBL052C 2496 nt0.65□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 UBP3YER151C 2739 nt0.65□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 PIG1YLR273C 1947 nt0.64□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 PPN1YDR452W 2025 nt0.64□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.64□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 HIT1YJR055W 495 nt0.64□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 AFB1YLR040C 675 nt0.64□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 NUT2YPR168W 474 nt0.64□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 SLM6YBR266C 453 nt0.64□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 ZIP1YDR285W 2628 nt0.64□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 MKT1YNL085W 2493 nt0.63□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 SHE9YDR393W 1371 nt0.63□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 GPM2YDL021W 936 nt0.63□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YGR045CYGR045C 363 nt0.63□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 RUF22RUF22 515 nt0.63□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 IRC16YPR038W 360 nt0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.2 ms