Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms