Protein–RNA interactions for Protein: P53200

EFM5, Protein-lysine N-methyltransferase EFM5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EFM5P53200 YGL204CYGL204C 306 nt0.49□□□□□ -2.33
EFM5P53200 PAU18YLL064C 363 nt0.49□□□□□ -2.33
EFM5P53200 VPS63YLR261C 327 nt0.49□□□□□ -2.33
EFM5P53200 PAU6YNR076W 363 nt0.49□□□□□ -2.33
EFM5P53200 SLM6YBR266C 453 nt0.49□□□□□ -2.33
EFM5P53200 KAR3YPR141C 2190 nt0.49□□□□□ -2.33
EFM5P53200 AIM44YPL158C 2277 nt0.48□□□□□ -2.33
EFM5P53200 ATC1YDR184C 885 nt0.48□□□□□ -2.33
EFM5P53200 ECM12YHR021W-A 456 nt0.48□□□□□ -2.33
EFM5P53200 snR44snR44 211 nt0.48□□□□□ -2.33
EFM5P53200 NUP82YJL061W 2142 nt0.47□□□□□ -2.33
EFM5P53200 RPL42BYHR141C 321 nt0.47□□□□□ -2.33
EFM5P53200 RPL42AYNL162W 321 nt0.47□□□□□ -2.33
EFM5P53200 YDL068WYDL068W 330 nt0.46□□□□□ -2.34
EFM5P53200 GIM5YML094W 492 nt0.46□□□□□ -2.34
EFM5P53200 YOR218CYOR218C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
EFM5P53200 YPR172WYPR172W 603 nt0.46□□□□□ -2.34
EFM5P53200 VPS74YDR372C 1038 nt0.45□□□□□ -2.34
EFM5P53200 PXA2YKL188C 2562 nt0.45□□□□□ -2.34
EFM5P53200 SAG1YJR004C 1953 nt0.45□□□□□ -2.34
EFM5P53200 HIT1YJR055W 495 nt0.44□□□□□ -2.34
EFM5P53200 UFE1YOR075W 1041 nt0.44□□□□□ -2.34
EFM5P53200 SLX9YGR081C 633 nt0.43□□□□□ -2.34
EFM5P53200 ATG16YMR159C 453 nt0.43□□□□□ -2.34
EFM5P53200 HDA3YPR179C 1968 nt0.43□□□□□ -2.34
EFM5P53200 RPS7BYNL096C 573 nt0.42□□□□□ -2.34
EFM5P53200 STO1YMR125W 2586 nt0.41□□□□□ -2.34
EFM5P53200 ALG13YGL047W 609 nt0.41□□□□□ -2.34
EFM5P53200 GPX1YKL026C 504 nt0.41□□□□□ -2.34
EFM5P53200 SUS1YBR111W-A 291 nt0.41□□□□□ -2.34
EFM5P53200 LTE1YAL024C 4308 nt0.4□□□□□ -2.34
EFM5P53200 ZIP1YDR285W 2628 nt0.4□□□□□ -2.34
EFM5P53200 PAN2YGL094C 3348 nt0.4□□□□□ -2.34
EFM5P53200 YDR509WYDR509W 348 nt0.4□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt0.4□□□□□ -2.35
EFM5P53200 IES4YOR189W 351 nt0.4□□□□□ -2.35
EFM5P53200 SPR2YOR214C 711 nt0.4□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YBR032WYBR032W 303 nt0.4□□□□□ -2.35
EFM5P53200 RUB1YDR139C 234 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YIL059CYIL059C 366 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 TIM8YJR135W-A 264 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 PDE2YOR360C 1581 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 MKT1YNL085W 2493 nt0.39□□□□□ -2.35
EFM5P53200 OCA6YDR067C 675 nt0.38□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.38□□□□□ -2.35
EFM5P53200 RMD6YEL072W 696 nt0.38□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.38□□□□□ -2.35
EFM5P53200 RUF22RUF22 515 nt0.38□□□□□ -2.35
EFM5P53200 FIG4YNL325C 2640 nt0.38□□□□□ -2.35
EFM5P53200 UTP20YBL004W 7482 nt0.38□□□□□ -2.35
EFM5P53200 LYS14YDR034C 2373 nt0.37□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YPL080CYPL080C 327 nt0.37□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YOP1YPR028W 543 nt0.37□□□□□ -2.35
EFM5P53200 MYO1YHR023W 5787 nt0.37□□□□□ -2.35
EFM5P53200 DBP6YNR038W 1890 nt0.36□□□□□ -2.35
EFM5P53200 SRP14YDL092W 441 nt0.36□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.36□□□□□ -2.35
EFM5P53200 TYE7YOR344C 876 nt0.36□□□□□ -2.35
EFM5P53200 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.35□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.35□□□□□ -2.35
EFM5P53200 DAD1YDR016C 285 nt0.35□□□□□ -2.35
EFM5P53200 FMP27YLR454W 7887 nt0.35□□□□□ -2.35
EFM5P53200 YSP1YHR155W 3687 nt0.35□□□□□ -2.35
EFM5P53200 ULP2YIL031W 3105 nt0.35□□□□□ -2.35
EFM5P53200 ALY2YJL084C 3141 nt0.34□□□□□ -2.35
EFM5P53200 CMS1YLR003C 876 nt0.34□□□□□ -2.36
EFM5P53200 ARV1YLR242C 966 nt0.34□□□□□ -2.36
EFM5P53200 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.34□□□□□ -2.36
EFM5P53200 ABF2YMR072W 552 nt0.34□□□□□ -2.36
EFM5P53200 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt0.34□□□□□ -2.36
EFM5P53200 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.33□□□□□ -2.36
EFM5P53200 VPS52YDR484W 1926 nt0.32□□□□□ -2.36
EFM5P53200 SWI5YDR146C 2130 nt0.32□□□□□ -2.36
EFM5P53200 SCW11YGL028C 1629 nt0.32□□□□□ -2.36
EFM5P53200 YCK3YER123W 1575 nt0.31□□□□□ -2.36
EFM5P53200 ISD11YER048W-A 285 nt0.3□□□□□ -2.36
EFM5P53200 RPL37AYLR185W 267 nt0.3□□□□□ -2.36
EFM5P53200 SPC2YML055W 537 nt0.3□□□□□ -2.36
EFM5P53200 UBX4YMR067C 1251 nt0.3□□□□□ -2.36
EFM5P53200 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.3□□□□□ -2.36
EFM5P53200 MMS4YBR098W 2076 nt0.29□□□□□ -2.36
EFM5P53200 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.29□□□□□ -2.36
EFM5P53200 DFG10YIL049W 762 nt0.29□□□□□ -2.36
EFM5P53200 SLD3YGL113W 2007 nt0.29□□□□□ -2.36
EFM5P53200 WIP1YDR374W-A 270 nt0.28□□□□□ -2.36
EFM5P53200 SPO13YHR014W 876 nt0.28□□□□□ -2.36
EFM5P53200 GMC2YLR445W 567 nt0.28□□□□□ -2.36
EFM5P53200 ATP20YPR020W 348 nt0.28□□□□□ -2.36
EFM5P53200 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.27□□□□□ -2.37
EFM5P53200 SDH2YLL041C 801 nt0.27□□□□□ -2.37
EFM5P53200 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 130.2 ms