Protein–RNA interactions for Protein: P25044

PTP1, Tyrosine-protein phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP1P25044 SRO77YBL106C 3033 nt2.41□□□□□ -2.02
PTP1P25044 COG3YER157W 2406 nt2.4□□□□□ -2.03
PTP1P25044 PDR11YIL013C 4236 nt2.4□□□□□ -2.03
PTP1P25044 GIN4YDR507C 3429 nt2.39□□□□□ -2.03
PTP1P25044 NPR3YHL023C 3441 nt2.39□□□□□ -2.03
PTP1P25044 TRM2YKR056W 1920 nt2.39□□□□□ -2.03
PTP1P25044 NPC2YDL046W 522 nt2.39□□□□□ -2.03
PTP1P25044 RPS22AYJL190C 393 nt2.39□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.39□□□□□ -2.03
PTP1P25044 snR48snR48 113 nt2.39□□□□□ -2.03
PTP1P25044 KRE33YNL132W 3171 nt2.39□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YGL069CYGL069C 465 nt2.38□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YIL059CYIL059C 366 nt2.38□□□□□ -2.03
PTP1P25044 VPS55YJR044C 423 nt2.38□□□□□ -2.03
PTP1P25044 RPL25YOL127W 429 nt2.38□□□□□ -2.03
PTP1P25044 HDA3YPR179C 1968 nt2.38□□□□□ -2.03
PTP1P25044 PDR1YGL013C 3207 nt2.37□□□□□ -2.03
PTP1P25044 IPT1YDR072C 1584 nt2.37□□□□□ -2.03
PTP1P25044 PUT3YKL015W 2940 nt2.37□□□□□ -2.03
PTP1P25044 FIR1YER032W 2631 nt2.37□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YGR164WYGR164W 336 nt2.37□□□□□ -2.03
PTP1P25044 PCC1YKR095W-A 267 nt2.37□□□□□ -2.03
PTP1P25044 RPL38YLR325C 237 nt2.37□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YBL083CYBL083C 426 nt2.37□□□□□ -2.03
PTP1P25044 PSO2YMR137C 1986 nt2.37□□□□□ -2.03
PTP1P25044 LEU3YLR451W 2661 nt2.36□□□□□ -2.03
PTP1P25044 TIM11YDR322C-A 291 nt2.36□□□□□ -2.03
PTP1P25044 RAM2YKL019W 951 nt2.36□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.36□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YGR250CYGR250C 2346 nt2.35□□□□□ -2.03
PTP1P25044 SUL1YBR294W 2580 nt2.35□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YEF3YLR249W 3135 nt2.35□□□□□ -2.03
PTP1P25044 RBK1YCR036W 1002 nt2.35□□□□□ -2.03
PTP1P25044 MRP10YDL045W-A 288 nt2.35□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YEL014CYEL014C 306 nt2.35□□□□□ -2.03
PTP1P25044 SMD1YGR074W 441 nt2.35□□□□□ -2.03
PTP1P25044 INA22YIR024C 651 nt2.35□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YNL028WYNL028W 318 nt2.35□□□□□ -2.03
PTP1P25044 KAR3YPR141C 2190 nt2.34□□□□□ -2.03
PTP1P25044 FAR11YNL127W 2862 nt2.34□□□□□ -2.03
PTP1P25044 YGL024WYGL024W 336 nt2.34□□□□□ -2.03
PTP1P25044 OLI1Q0130 231 nt2.34□□□□□ -2.03
PTP1P25044 RPS29AYLR388W 171 nt2.34□□□□□ -2.03
PTP1P25044 CSE2YNR010W 450 nt2.34□□□□□ -2.03
PTP1P25044 RTC6YPL183W-A 282 nt2.34□□□□□ -2.03
PTP1P25044 RTT10YPL183C 3042 nt2.34□□□□□ -2.03
PTP1P25044 SPB1YCL054W 2526 nt2.34□□□□□ -2.04
PTP1P25044 ARP8YOR141C 2646 nt2.33□□□□□ -2.04
PTP1P25044 MLH1YMR167W 2310 nt2.33□□□□□ -2.04
PTP1P25044 SSS1YDR086C 243 nt2.33□□□□□ -2.04
PTP1P25044 COF1YLL050C 432 nt2.33□□□□□ -2.04
PTP1P25044 VTC1YER072W 390 nt2.32□□□□□ -2.04
PTP1P25044 RPS27AYKL156W 249 nt2.32□□□□□ -2.04
PTP1P25044 LSM7YNL147W 348 nt2.32□□□□□ -2.04
PTP1P25044 NUT2YPR168W 474 nt2.32□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YBR224WYBR224W 516 nt2.32□□□□□ -2.04
PTP1P25044 RLI1YDR091C 1827 nt2.32□□□□□ -2.04
PTP1P25044 BNR1YIL159W 4128 nt2.32□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YBT1YLL048C 4986 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YDR426CYDR426C 378 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 RRT15YLR162W-A 189 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 HSC82YMR186W 2118 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 KTI11YBL071W-A 249 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YBR178WYBR178W 375 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 LCD1YDR499W 2244 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YOL098CYOL098C 3114 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 TRA1YHR099W 11235 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 RLF2YPR018W 1821 nt2.31□□□□□ -2.04
PTP1P25044 MPH1YIR002C 2982 nt2.3□□□□□ -2.04
PTP1P25044 SCP160YJL080C 3669 nt2.3□□□□□ -2.04
PTP1P25044 snR74snR74 88 nt2.3□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YGL217CYGL217C 342 nt2.3□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.3□□□□□ -2.04
PTP1P25044 snR46snR46 197 nt2.3□□□□□ -2.04
PTP1P25044 SPF1YEL031W 3648 nt2.29□□□□□ -2.04
PTP1P25044 SSQ1YLR369W 1974 nt2.29□□□□□ -2.04
PTP1P25044 PDE2YOR360C 1581 nt2.29□□□□□ -2.04
PTP1P25044 KIP1YBL063W 3336 nt2.29□□□□□ -2.04
PTP1P25044 TMN3YER113C 2121 nt2.29□□□□□ -2.04
PTP1P25044 TRX1YLR043C 312 nt2.28□□□□□ -2.04
PTP1P25044 GRX8YLR364W 330 nt2.28□□□□□ -2.04
PTP1P25044 FPR1YNL135C 345 nt2.28□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YOR055WYOR055W 435 nt2.28□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YOR333CYOR333C 417 nt2.28□□□□□ -2.04
PTP1P25044 YOR376WYOR376W 369 nt2.28□□□□□ -2.04
PTP1P25044 PAN3YKL025C 2040 nt2.28□□□□□ -2.04
PTP1P25044 RGA1YOR127W 3024 nt2.28□□□□□ -2.05
PTP1P25044 TOF2YKR010C 2316 nt2.28□□□□□ -2.05
PTP1P25044 CDC27YBL084C 2277 nt2.28□□□□□ -2.05
PTP1P25044 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.27□□□□□ -2.05
PTP1P25044 CRS5YOR031W 210 nt2.27□□□□□ -2.05
PTP1P25044 APL5YPL195W 2799 nt2.27□□□□□ -2.05
PTP1P25044 PUF4YGL014W 2667 nt2.27□□□□□ -2.05
PTP1P25044 SWA2YDR320C 2007 nt2.27□□□□□ -2.05
PTP1P25044 VPS35YJL154C 2835 nt2.27□□□□□ -2.05
PTP1P25044 DNL4YOR005C 2835 nt2.27□□□□□ -2.05
PTP1P25044 SAC3YDR159W 3906 nt2.26□□□□□ -2.05
PTP1P25044 PHO91YNR013C 2685 nt2.26□□□□□ -2.05
PTP1P25044 PSD2YGR170W 3417 nt2.26□□□□□ -2.05
PTP1P25044 DOT6YER088C 2013 nt2.26□□□□□ -2.05
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