Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCP23508 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCP23508 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCP23508 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCP23508 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCP23508 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCP23508 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCP23508 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCP23508 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCP23508 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms