Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHAC2Q9Y5I4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms