Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM43Q96BQ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM43Q96BQ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms