Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TCTN1Q2MV58 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCTN1Q2MV58 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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