Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKN3Q16667 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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