Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 YPR146CYPR146C 330 nt1.58□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 PEP1YBL017C 4740 nt1.58□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 MSH6YDR097C 3729 nt1.58□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 ZRG8YER033C 3231 nt1.58□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 COX1Q0045 1605 nt1.58□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 SWT1YOR166C 1377 nt1.58□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YCR001WYCR001W 315 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 PAU3YCR104W 375 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 RPF1YHR088W 888 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YHR125WYHR125W 306 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 FCF2YLR051C 654 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 SYM1YLR251W 594 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YLR269CYLR269C 351 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YPL068CYPL068C 882 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YPL238CYPL238C 390 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 SAC3YDR159W 3906 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 PEX8YGR077C 1770 nt1.57□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 FIG2YCR089W 4830 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YCR043CYCR043C 384 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 BI2Q0110 1272 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YGR025WYGR025W 303 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YLR171WYLR171W 390 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YOR146WYOR146W 306 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 GAL7YBR018C 1101 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 snR13snR13 124 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 CDC24YAL041W 2565 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 IRE1YHR079C 3348 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 SEC63YOR254C 1992 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 DOT6YER088C 2013 nt1.56□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 ECL1YGR146C 636 nt1.55□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 NBL1YHR199C-A 222 nt1.55□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 CRG1YHR209W 876 nt1.55□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 CMC2YBL059C-A 330 nt1.55□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 DAS1YJL149W 1992 nt1.55□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.55□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 TFC8YPL007C 1767 nt1.54□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 SEY1YOR165W 2331 nt1.54□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.54□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 AIM29YKR074W 468 nt1.54□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 ATP19YOL077W-A 207 nt1.54□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 EGD1YPL037C 474 nt1.54□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 RKM1YPL208W 1752 nt1.54□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 HSL1YKL101W 4557 nt1.53□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 YLR456WYLR456W 615 nt1.53□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 TIF11YMR260C 462 nt1.53□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 snR54snR54 86 nt1.53□□□□□ -2.16
RPN6Q12377 SEF1YBL066C 3447 nt1.53□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YJR039WYJR039W 3366 nt1.53□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 SBE22YHR103W 2559 nt1.53□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 QCR7YDR529C 384 nt1.52□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 HUR1YGL168W 333 nt1.52□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YLR202CYLR202C 327 nt1.52□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.52□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.51□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.51□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 RPL42BYHR141C 321 nt1.51□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 CGI121YML036W 546 nt1.51□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 COA6YMR244C-A 315 nt1.51□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 RPL42AYNL162W 321 nt1.51□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 ASM4YDL088C 1587 nt1.51□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YBP1YBR216C 2025 nt1.5□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YGR250CYGR250C 2346 nt1.5□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 snR41snR41 95 nt1.5□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 CTR9YOL145C 3234 nt1.5□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 FRK1YPL141C 2598 nt1.5□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 NOP53YPL146C 1368 nt1.49□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 TMA22YJR014W 597 nt1.49□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 TOM22YNL131W 459 nt1.49□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 FMP23YBR047W 528 nt1.49□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YPR099CYPR099C 357 nt1.49□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YBR174CYBR174C 315 nt1.49□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 IRA1YBR140C 9279 nt1.49□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 GNT1YOR320C 1476 nt1.49□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 MEC1YBR136W 7107 nt1.48□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 TDA9YML081W 3756 nt1.48□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YOR019WYOR019W 2193 nt1.48□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 CHS1YNL192W 3396 nt1.48□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 ATG11YPR049C 3537 nt1.47□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YDL152WYDL152W 366 nt1.47□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.47□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 URM1YIL008W 300 nt1.47□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.47□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 NUP120YKL057C 3114 nt1.47□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 PAN3YKL025C 2040 nt1.47□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 HIR3YJR140C 4947 nt1.47□□□□□ -2.17
RPN6Q12377 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.46□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.46□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.46□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 CDC33YOL139C 642 nt1.46□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 YBR032WYBR032W 303 nt1.46□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 REV3YPL167C 4515 nt1.46□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 RLM1YPL089C 2031 nt1.45□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 TOF2YKR010C 2316 nt1.45□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 HMI1YOL095C 2121 nt1.45□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 BPH1YCR032W 6504 nt1.45□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 MSC6YOR354C 2079 nt1.45□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 YBL073WYBL073W 312 nt1.45□□□□□ -2.18
RPN6Q12377 CCH1YGR217W 6120 nt1.45□□□□□ -2.18
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