Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 UFD4YKL010C 4452 nt1.87□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 UBP2YOR124C 3819 nt1.87□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 PLC1YPL268W 2610 nt1.87□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 YBR184WYBR184W 1572 nt1.87□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 SAP190YKR028W 3102 nt1.87□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 ATG9YDL149W 2994 nt1.87□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 DOT6YER088C 2013 nt1.86□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 SLN1YIL147C 3663 nt1.86□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 ZRG8YER033C 3231 nt1.86□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 YCR043CYCR043C 384 nt1.86□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.86□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 BRP1YGL007W 378 nt1.86□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 PDR8YLR266C 2106 nt1.86□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 DGR1YNL130C-A 147 nt1.86□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 MKT1YNL085W 2493 nt1.86□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 MYO2YOR326W 4725 nt1.85□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 ARP7YPR034W 1434 nt1.85□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.85□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 YDR114CYDR114C 303 nt1.85□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 FYV12YOR183W 390 nt1.85□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 YPR099CYPR099C 357 nt1.85□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 SEF1YBL066C 3447 nt1.84□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 YDL152WYDL152W 366 nt1.84□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 BTT1YDR252W 450 nt1.84□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 TMA7YLR262C-A 195 nt1.84□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.84□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.84□□□□□ -2.11
VAM3Q12241 MGA2YIR033W 3342 nt1.83□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 AGA2YGL032C 264 nt1.83□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.83□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YKL202WYKL202W 582 nt1.83□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YLR287CYLR287C 1068 nt1.83□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YPR177CYPR177C 372 nt1.83□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 DIE2YGR227W 1578 nt1.83□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.82□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 UTP22YGR090W 3714 nt1.82□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 IRC20YLR247C 4671 nt1.82□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 DAS1YJL149W 1992 nt1.82□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 GCN4YEL009C 846 nt1.82□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 RPS24AYER074W 408 nt1.82□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 CFT2YLR115W 2580 nt1.82□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 HCS1YKL017C 2052 nt1.81□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 VTC1YER072W 390 nt1.81□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.81□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 CGI121YML036W 546 nt1.81□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YBL071CYBL071C 309 nt1.81□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 PUT3YKL015W 2940 nt1.81□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 PAN3YKL025C 2040 nt1.81□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 GNT1YOR320C 1476 nt1.81□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YJR098CYJR098C 1971 nt1.8□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 CBS1YDL069C 690 nt1.8□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 SDH7YDR511W 402 nt1.8□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.8□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 IRR1YIL026C 3453 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YDL118WYDL118W 381 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YGL239CYGL239C 315 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YBL012CYBL012C 402 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 UBC7YMR022W 498 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 RRT1YBL048W 312 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YPL182CYPL182C 384 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YPL238CYPL238C 390 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 LRE1YCL051W 1752 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 TOF2YKR010C 2316 nt1.79□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 LHS1YKL073W 2646 nt1.78□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 ALK2YBL009W 2031 nt1.78□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YFL019CYFL019C 354 nt1.78□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 RPL42BYHR141C 321 nt1.78□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.78□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 RPL42AYNL162W 321 nt1.78□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 MRPL50YNR022C 420 nt1.78□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 INO80YGL150C 4470 nt1.78□□□□□ -2.12
VAM3Q12241 MYO4YAL029C 4416 nt1.77□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YOR093CYOR093C 4947 nt1.77□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.77□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 DIS3YOL021C 3006 nt1.77□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 NEO1YIL048W 3456 nt1.76□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 RTT102YGR275W 474 nt1.76□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 RPS24BYIL069C 408 nt1.76□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 ATP7YKL016C 525 nt1.76□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.76□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.76□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 TFC8YPL007C 1767 nt1.76□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 SEC63YOR254C 1992 nt1.76□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YER079WYER079W 633 nt1.75□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.75□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 RPA34YJL148W 702 nt1.75□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YNL114CYNL114C 372 nt1.75□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YOL159CYOL159C 516 nt1.75□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YOR146WYOR146W 306 nt1.75□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YOR392WYOR392W 444 nt1.75□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 DFG16YOR030W 1860 nt1.75□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.74□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 FMP23YBR047W 528 nt1.74□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YPL185WYPL185W 396 nt1.74□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.74□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 DNF3YMR162C 4971 nt1.74□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YGR250CYGR250C 2346 nt1.73□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 SEY1YOR165W 2331 nt1.73□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 SWF1YDR126W 1011 nt1.73□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YBL073WYBL073W 312 nt1.73□□□□□ -2.13
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