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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
UFD4
YKL010C
4452 nt
1.87
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
UBP2
YOR124C
3819 nt
1.87
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
PLC1
YPL268W
2610 nt
1.87
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YBR184W
YBR184W
1572 nt
1.87
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
SAP190
YKR028W
3102 nt
1.87
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
ATG9
YDL149W
2994 nt
1.87
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
DOT6
YER088C
2013 nt
1.86
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
SLN1
YIL147C
3663 nt
1.86
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
ZRG8
YER033C
3231 nt
1.86
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YCR043C
YCR043C
384 nt
1.86
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YER087C-A
YER087C-A
552 nt
1.86
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
BRP1
YGL007W
378 nt
1.86
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
PDR8
YLR266C
2106 nt
1.86
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
DGR1
YNL130C-A
147 nt
1.86
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
MKT1
YNL085W
2493 nt
1.86
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
MYO2
YOR326W
4725 nt
1.85
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
ARP7
YPR034W
1434 nt
1.85
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YCR102W-A
YCR102W-A
198 nt
1.85
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YDR114C
YDR114C
303 nt
1.85
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
FYV12
YOR183W
390 nt
1.85
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YPR099C
YPR099C
357 nt
1.85
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
SEF1
YBL066C
3447 nt
1.84
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YDL152W
YDL152W
366 nt
1.84
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
BTT1
YDR252W
450 nt
1.84
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
TMA7
YLR262C-A
195 nt
1.84
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YML009C-A
YML009C-A
327 nt
1.84
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
YOR192C-C
YOR192C-C
237 nt
1.84
□□□□□ -2.11
VAM3
Q12241
MGA2
YIR033W
3342 nt
1.83
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
AGA2
YGL032C
264 nt
1.83
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YHL009W-A
YHL009W-A
1242 nt
1.83
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YKL202W
YKL202W
582 nt
1.83
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YLR287C
YLR287C
1068 nt
1.83
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YPR177C
YPR177C
372 nt
1.83
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
DIE2
YGR227W
1578 nt
1.83
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YOR343W-B
YOR343W-B
5313 nt
1.82
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
UTP22
YGR090W
3714 nt
1.82
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
IRC20
YLR247C
4671 nt
1.82
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
DAS1
YJL149W
1992 nt
1.82
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
GCN4
YEL009C
846 nt
1.82
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
RPS24A
YER074W
408 nt
1.82
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
CFT2
YLR115W
2580 nt
1.82
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
HCS1
YKL017C
2052 nt
1.81
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
VTC1
YER072W
390 nt
1.81
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YKL183C-A
YKL183C-A
213 nt
1.81
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
CGI121
YML036W
546 nt
1.81
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YBL071C
YBL071C
309 nt
1.81
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
PUT3
YKL015W
2940 nt
1.81
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
PAN3
YKL025C
2040 nt
1.81
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
GNT1
YOR320C
1476 nt
1.81
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YJR098C
YJR098C
1971 nt
1.8
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
CBS1
YDL069C
690 nt
1.8
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
SDH7
YDR511W
402 nt
1.8
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YHR073W-A
YHR073W-A
177 nt
1.8
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
IRR1
YIL026C
3453 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YDL118W
YDL118W
381 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YGL239C
YGL239C
315 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YBL012C
YBL012C
402 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
UBC7
YMR022W
498 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
RRT1
YBL048W
312 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YPL182C
YPL182C
384 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YPL238C
YPL238C
390 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
LRE1
YCL051W
1752 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
TOF2
YKR010C
2316 nt
1.79
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
LHS1
YKL073W
2646 nt
1.78
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
ALK2
YBL009W
2031 nt
1.78
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YFL019C
YFL019C
354 nt
1.78
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
RPL42B
YHR141C
321 nt
1.78
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
YMR001C-A
YMR001C-A
231 nt
1.78
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
RPL42A
YNL162W
321 nt
1.78
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
MRPL50
YNR022C
420 nt
1.78
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
INO80
YGL150C
4470 nt
1.78
□□□□□ -2.12
VAM3
Q12241
MYO4
YAL029C
4416 nt
1.77
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YOR093C
YOR093C
4947 nt
1.77
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YER088C-A
YER088C-A
324 nt
1.77
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
DIS3
YOL021C
3006 nt
1.77
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
NEO1
YIL048W
3456 nt
1.76
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
RTT102
YGR275W
474 nt
1.76
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
RPS24B
YIL069C
408 nt
1.76
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
ATP7
YKL016C
525 nt
1.76
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YLR154W-F
YLR154W-F
141 nt
1.76
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YMR247W-A
YMR247W-A
144 nt
1.76
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
TFC8
YPL007C
1767 nt
1.76
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
SEC63
YOR254C
1992 nt
1.76
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YER079W
YER079W
633 nt
1.75
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YIL066W-A
YIL066W-A
444 nt
1.75
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
RPA34
YJL148W
702 nt
1.75
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YNL114C
YNL114C
372 nt
1.75
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YOL159C
YOL159C
516 nt
1.75
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YOR146W
YOR146W
306 nt
1.75
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YOR392W
YOR392W
444 nt
1.75
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
DFG16
YOR030W
1860 nt
1.75
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
tT(UGU)H
tT(UGU)H
72 nt
1.74
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
FMP23
YBR047W
528 nt
1.74
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YPL185W
YPL185W
396 nt
1.74
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
MF(ALPHA)1
YPL187W
498 nt
1.74
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
DNF3
YMR162C
4971 nt
1.74
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YGR250C
YGR250C
2346 nt
1.73
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
SEY1
YOR165W
2331 nt
1.73
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
SWF1
YDR126W
1011 nt
1.73
□□□□□ -2.13
VAM3
Q12241
YBL073W
YBL073W
312 nt
1.73
□□□□□ -2.13
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