Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YAF9YNL107W 681 nt2.09□□□□□ -2.07
SSK1Q07084 AFI1YOR129C 2682 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 TIM9YEL020W-A 264 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YBL073WYBL073W 312 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YPR099CYPR099C 357 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 LYS9YNR050C 1341 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 DIS3YOL021C 3006 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 UBR1YGR184C 5853 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 STB4YMR019W 2850 nt2.08□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YFR016CYFR016C 3702 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 SOK2YMR016C 2358 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 CDC53YDL132W 2448 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 DAD4YDR320C-A 219 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 PAU8YAL068C 363 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 TMA10YLR327C 261 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 HCH1YNL281W 462 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 PAU20YOL161C 363 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YSY6YBR162W-A 198 nt2.07□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 VPS41YDR080W 2979 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YDL152WYDL152W 366 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 RPS24AYER074W 408 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YGL069CYGL069C 465 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 PGA1YNL158W 597 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 IRC23YOR044W 474 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 TIM18YOR297C 579 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 UFD4YKL010C 4452 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 DOT6YER088C 2013 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 PDR3YBL005W 2931 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 KAP123YER110C 3342 nt2.06□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 MCD1YDL003W 1701 nt2.05□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 CDC27YBL084C 2277 nt2.05□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 ABM1YJR108W 372 nt2.05□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 PSY1YKL076C 384 nt2.05□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YKL136WYKL136W 399 nt2.05□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 BIL1YOR304C-A 231 nt2.05□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 NOT5YPR072W 1683 nt2.05□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 NAB6YML117W 3405 nt2.05□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 SAP185YJL098W 3177 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 TFC3YAL001C 3483 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YFH1YDL120W 525 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 RPL27BYDR471W 411 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 AIM9YER080W 1884 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 TMN3YER113C 2121 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 TIM13YGR181W 318 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 PAN3YKL025C 2040 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YLR149CYLR149C 2193 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 RPL32YBL092W 393 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 UBP2YOR124C 3819 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YBR224WYBR224W 516 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 CRM1YGR218W 3255 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 RIC1YLR039C 3171 nt2.04□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 NUP100YKL068W 2880 nt2.03□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YDR102CYDR102C 333 nt2.03□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YKL083WYKL083W 615 nt2.03□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YKL118WYKL118W 312 nt2.03□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.03□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 VMR1YHL035C 4779 nt2.03□□□□□ -2.08
SSK1Q07084 NOP14YDL148C 2433 nt2.02□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 ELG1YOR144C 2376 nt2.02□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 PHS1YJL097W 654 nt2.02□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 RPS17AYML024W 411 nt2.02□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.02□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 CLN3YAL040C 1743 nt2.02□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 RBK1YCR036W 1002 nt2.01□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 NHP2YDL208W 471 nt2.01□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YDR286CYDR286C 345 nt2.01□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 HSK3YKL138C-A 210 nt2.01□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 MET18YIL128W 3099 nt2.01□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 VTC3YPL019C 2508 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YPR097WYPR097W 3222 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 HOP2YGL033W 657 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YOR333CYOR333C 417 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YPL229WYPL229W 621 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 RAV1YJR033C 4074 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 PEP3YLR148W 2757 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 TOF2YKR010C 2316 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 SPP41YDR464W 4308 nt2□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YER097WYER097W 330 nt1.99□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YHL037CYHL037C 402 nt1.99□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.99□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 RPA34YJL148W 702 nt1.99□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YBP1YBR216C 2025 nt1.99□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 SEF1YBL066C 3447 nt1.99□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 SCH9YHR205W 2475 nt1.98□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YDR413CYDR413C 576 nt1.98□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 DGR1YNL130C-A 147 nt1.98□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YBL083CYBL083C 426 nt1.98□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.98□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YOR199WYOR199W 330 nt1.98□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 SCP160YJL080C 3669 nt1.98□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YBR184WYBR184W 1572 nt1.98□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 SET2YJL168C 2202 nt1.97□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YDR008CYDR008C 351 nt1.97□□□□□ -2.09
SSK1Q07084 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.97□□□□□ -2.09
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