Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 YBR184WYBR184W 1572 nt3.42□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 SEF1YBL066C 3447 nt3.41□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 KSP1YHR082C 3090 nt3.41□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 YAK1YJL141C 2424 nt3.41□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 USE1YGL098W 738 nt3.41□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 SPT4YGR063C 309 nt3.41□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 YLR012CYLR012C 300 nt3.41□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 YLR149CYLR149C 2193 nt3.41□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 CHO2YGR157W 2610 nt3.4□□□□□ -1.86
HDA3Q06623 GRR1YJR090C 3456 nt3.39□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 YDR544CYDR544C 429 nt3.39□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 snR43snR43 209 nt3.39□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 SMY1YKL079W 1971 nt3.38□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 RRP5YMR229C 5190 nt3.38□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 MPT5YGL178W 2580 nt3.38□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 PMP1YCR024C-A 123 nt3.38□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 MCM10YIL150C 1716 nt3.38□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 PXA2YKL188C 2562 nt3.38□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 YPR089WYPR089W 2667 nt3.37□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 ROG1YGL144C 2058 nt3.37□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 CLN3YAL040C 1743 nt3.37□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 FAP7YDL166C 594 nt3.37□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 YMR326CYMR326C 309 nt3.37□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 RPL33BYOR234C 324 nt3.37□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 PKH1YDR490C 2301 nt3.37□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 SWI6YLR182W 2412 nt3.36□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 SNF5YBR289W 2718 nt3.36□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt3.35□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 RSF2YJR127C 4143 nt3.34□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 DNL4YOR005C 2835 nt3.34□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 PFF1YBR074W 2931 nt3.34□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 YIR044CYIR044C 186 nt3.34□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 RPL22AYLR061W 366 nt3.34□□□□□ -1.87
HDA3Q06623 STU2YLR045C 2667 nt3.34□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 FLO9YAL063C 3969 nt3.34□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 TSC11YER093C 4293 nt3.33□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 MET5YJR137C 4329 nt3.33□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 BMS1YPL217C 3552 nt3.33□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 RPA135YPR010C 3612 nt3.33□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 FMP16YDR070C 282 nt3.33□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 RPB10YOR210W 213 nt3.33□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 RPS12YOR369C 432 nt3.33□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 AUS1YOR011W 4185 nt3.33□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 STT4YLR305C 5703 nt3.33□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 ENA5YDR038C 3276 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 ENA2YDR039C 3276 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 ENA1YDR040C 3276 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 DBP7YKR024C 2229 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 HRD3YLR207W 2502 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 PRP6YBR055C 2700 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 PEP3YLR148W 2757 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 YFL065CYFL065C 309 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 ELG1YOR144C 2376 nt3.32□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 YDL242WYDL242W 354 nt3.31□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 RPS21AYKR057W 264 nt3.31□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 KAP123YER110C 3342 nt3.31□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 PSK1YAL017W 4071 nt3.31□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 RIC1YLR039C 3171 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 GCN1YGL195W 8019 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 TFB5YDR079C-A 219 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 NOP10YHR072W-A 177 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 EMC6YLL014W 327 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 SLY1YDR189W 2001 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 MIT1YEL007W 2001 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 RPH1YER169W 2391 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 YEL025CYEL025C 3567 nt3.3□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 DSE4YNR067C 3354 nt3.29□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt3.29□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 YOR345CYOR345C 351 nt3.29□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 PIG1YLR273C 1947 nt3.29□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 MMS22YLR320W 4365 nt3.28□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 NIP100YPL174C 2607 nt3.28□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 snR72snR72 98 nt3.28□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 YNL114CYNL114C 372 nt3.28□□□□□ -1.88
HDA3Q06623 SUL1YBR294W 2580 nt3.27□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 PAU10YDR542W 363 nt3.27□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 PAU11YGL261C 363 nt3.27□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 YGR050CYGR050C 357 nt3.27□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 PAU4YLR461W 363 nt3.27□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 YBR174CYBR174C 315 nt3.27□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt3.27□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 RFX1YLR176C 2436 nt3.27□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 RRP12YPL012W 3687 nt3.26□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 YSP2YDR326C 4317 nt3.26□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 RPL23BYER117W 414 nt3.26□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 RTT10YPL183C 3042 nt3.26□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 AKR1YDR264C 2295 nt3.25□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 BRP1YGL007W 378 nt3.25□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 YHR217CYHR217C 462 nt3.25□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt3.25□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 COY1YKL179C 2040 nt3.25□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 REC8YPR007C 2043 nt3.25□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 SCH9YHR205W 2475 nt3.25□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 SPO75YLL005C 2607 nt3.24□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 RRM3YHR031C 2172 nt3.24□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 TFC1YBR123C 1950 nt3.24□□□□□ -1.89
HDA3Q06623 HYP2YEL034W 474 nt3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.5 ms