Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 PAC1YOR269W 1485 nt2.02□□□□□ -2.09
AVT5P38176 CYC7YEL039C 342 nt2.02□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.02□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.02□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.02□□□□□ -2.09
AVT5P38176 HSK3YKL138C-A 210 nt2.01□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YNL337WYNL337W 255 nt2.01□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YBR277CYBR277C 402 nt2.01□□□□□ -2.09
AVT5P38176 INP53YOR109W 3324 nt2.01□□□□□ -2.09
AVT5P38176 RGA1YOR127W 3024 nt2.01□□□□□ -2.09
AVT5P38176 KAR3YPR141C 2190 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 EDS1YBR033W 2760 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 PDR11YIL013C 4236 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 CBF2YGR140W 2871 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 Q0032Q0032 291 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 MRP10YDL045W-A 288 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 snR80snR80 171 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YDR048CYDR048C 315 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YER121WYER121W 345 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YGR069WYGR069W 336 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 MBB1YJL199C 327 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 LCL2YLR104W 396 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YNL010WYNL010W 726 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YOP1YPR028W 543 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 KRE33YNL132W 3171 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 AIM9YER080W 1884 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 OSW7YFR039C 1533 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 JIP5YPR169W 1479 nt2□□□□□ -2.09
AVT5P38176 LYS9YNR050C 1341 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 TIM13YGR181W 318 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YGR265WYGR265W 411 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 TAR1YLR154W-C 375 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 RPL32YBL092W 393 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YOR225WYOR225W 330 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 STE11YLR362W 2154 nt1.99□□□□□ -2.09
AVT5P38176 PTP3YER075C 2787 nt1.98□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.98□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YGL239CYGL239C 315 nt1.98□□□□□ -2.09
AVT5P38176 GIS1YDR096W 2685 nt1.98□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YJL070CYJL070C 2667 nt1.98□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YEL043WYEL043W 2871 nt1.98□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.97□□□□□ -2.09
AVT5P38176 QCR7YDR529C 384 nt1.97□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.97□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt1.97□□□□□ -2.09
AVT5P38176 PHS1YJL097W 654 nt1.97□□□□□ -2.09
AVT5P38176 HTB2YBL002W 396 nt1.97□□□□□ -2.09
AVT5P38176 UBP11YKR098C 2154 nt1.97□□□□□ -2.09
AVT5P38176 UBR1YGR184C 5853 nt1.97□□□□□ -2.09
AVT5P38176 SSD1YDR293C 3753 nt1.97□□□□□ -2.09
AVT5P38176 STH1YIL126W 4080 nt1.96□□□□□ -2.09
AVT5P38176 YFR016CYFR016C 3702 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 FMP16YDR070C 282 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YGL041CYGL041C 204 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YHL041WYHL041W 450 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 PAU8YAL068C 363 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 LSM7YNL147W 348 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 PAU20YOL161C 363 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 RTC6YPL183W-A 282 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 PTC5YOR090C 1719 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 RAV1YJR033C 4074 nt1.96□□□□□ -2.1
AVT5P38176 OSH6YKR003W 1347 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 DBP6YNR038W 1890 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 IPT1YDR072C 1584 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YDL062WYDL062W 426 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YDR344CYDR344C 444 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 SAR1YPL218W 573 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YPR099CYPR099C 357 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 SAP185YJL098W 3177 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 NUP100YKL068W 2880 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 DOT6YER088C 2013 nt1.95□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YDR186CYDR186C 2634 nt1.94□□□□□ -2.1
AVT5P38176 RBK1YCR036W 1002 nt1.94□□□□□ -2.1
AVT5P38176 TIM9YEL020W-A 264 nt1.94□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YGL024WYGL024W 336 nt1.94□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YNL198CYNL198C 303 nt1.94□□□□□ -2.1
AVT5P38176 RRP6YOR001W 2202 nt1.94□□□□□ -2.1
AVT5P38176 BNI1YNL271C 5862 nt1.93□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YDL211CYDL211C 1119 nt1.93□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YRB1YDR002W 606 nt1.93□□□□□ -2.1
AVT5P38176 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.93□□□□□ -2.1
AVT5P38176 BLI1YKL061W 342 nt1.93□□□□□ -2.1
AVT5P38176 RPS27AYKL156W 249 nt1.93□□□□□ -2.1
AVT5P38176 NCL1YBL024W 2055 nt1.93□□□□□ -2.1
AVT5P38176 MPH1YIR002C 2982 nt1.93□□□□□ -2.1
AVT5P38176 SGS1YMR190C 4344 nt1.93□□□□□ -2.1
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