Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NECAP2Q9NVZ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms