Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
WDR53Q7Z5U6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
WDR53Q7Z5U6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms