Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHA9Q7RTU4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms