Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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EXT1Q16394 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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EXT1Q16394 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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EXT1Q16394 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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EXT1Q16394 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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EXT1Q16394 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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EXT1Q16394 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXT1Q16394 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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