Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YJR141WYJR141W 1044 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 SAR1YPL218W 573 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 MUD2YKL074C 1584 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 GUP1YGL084C 1683 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 HSL1YKL101W 4557 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 UTP21YLR409C 2820 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 TDA9YML081W 3756 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YDL158CYDL158C 309 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 RTR2YDR066C 591 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 IRC19YLL033W 693 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 SEN15YMR059W 387 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 COA6YMR244C-A 315 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 PGA1YNL158W 597 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 SPC29YPL124W 762 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 VPS52YDR484W 1926 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YJR039WYJR039W 3366 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 RPH1YER169W 2391 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 HIR3YJR140C 4947 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 RBK1YCR036W 1002 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YDL041WYDL041W 354 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 LSO2YGR169C-A 279 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 SPC1YJR010C-A 285 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YKL044WYKL044W 321 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 BER1YLR412W 825 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 BRR2YER172C 6492 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YLR149CYLR149C 2193 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 SOK2YMR016C 2358 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 IRA1YBR140C 9279 nt1.55□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 CAT8YMR280C 4302 nt1.55□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.55□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YJR079WYJR079W 330 nt1.55□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 MRPL44YMR225C 297 nt1.55□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 MEI5YPL121C 669 nt1.55□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 GPX2YBR244W 489 nt1.55□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 PRM8YGL053W 714 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 RPC10YHR143W-A 213 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YNR025CYNR025C 360 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 LYS9YNR050C 1341 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 NOT5YPR072W 1683 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 SBE22YHR103W 2559 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 YDR029WYDR029W 315 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 ATP17YDR377W 306 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 DAS1YJL149W 1992 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 SYM1YLR251W 594 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 CTK3YML112W 891 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 TIF11YMR260C 462 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 RCN2YOR220W 798 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP42Q12277 KAR3YPR141C 2190 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 PET309YLR067C 2898 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YCR043CYCR043C 384 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 UBX4YMR067C 1251 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YBL083CYBL083C 426 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 KCS1YDR017C 3153 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 CDC24YAL041W 2565 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 SGD1YLR336C 2700 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 RPL31AYDL075W 342 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YER121WYER121W 345 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 ILM1YJR118C 612 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 COX7YMR256C 183 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 IRC16YPR038W 360 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YBR224WYBR224W 516 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 RKM1YPL208W 1752 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 MON2YNL297C 4911 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 IES5YER092W 378 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 GIC1YHR061C 945 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YKL111CYKL111C 336 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 SLM1YIL105C 2061 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 SEC63YOR254C 1992 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YLR419WYLR419W 4308 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 HNT1YDL125C 477 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 snR84snR84 550 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 SAC3YDR159W 3906 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 ADR1YDR216W 3972 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YJR098CYJR098C 1971 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 PHR1YOR386W 1698 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 ZRG8YER033C 3231 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 MDM20YOL076W 2391 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YIL102CYIL102C 306 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 SVS1YPL163C 783 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 SLM6YBR266C 453 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 SPR3YGR059W 1539 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 TFC8YPL007C 1767 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 IRR1YIL026C 3453 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 SNU56YDR240C 1479 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 CHS1YNL192W 3396 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 MSH6YDR097C 3729 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 MNL2YLR057W 2550 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 snR79snR79 84 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 STE18YJR086W 333 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YPR153WYPR153W 423 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 YPR177CYPR177C 372 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP42Q12277 MSC6YOR354C 2079 nt1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.9 ms