Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 RTR2YDR066C 591 nt1.37□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 RPB11YOL005C 363 nt1.37□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 FYV12YOR183W 390 nt1.37□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YCL007CYCL007C 393 nt1.37□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 SGD1YLR336C 2700 nt1.37□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 snR5snR5 204 nt1.36□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YHR054CYHR054C 1065 nt1.36□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 SEC22YLR268W 645 nt1.36□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YHC1YLR298C 696 nt1.36□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YPR172WYPR172W 603 nt1.36□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YLR419WYLR419W 4308 nt1.35□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 SNF5YBR289W 2718 nt1.35□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 MSC6YOR354C 2079 nt1.35□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 FSH1YHR049W 732 nt1.35□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 PET123YOR158W 957 nt1.35□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YBR224WYBR224W 516 nt1.35□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 SMY1YKL079W 1971 nt1.35□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 MAD1YGL086W 2250 nt1.35□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 RLM1YPL089C 2031 nt1.34□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 IES5YER092W 378 nt1.34□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YLR255CYLR255C 354 nt1.34□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt1.34□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YMR324CYMR324C 243 nt1.34□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 PEP3YLR148W 2757 nt1.34□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 BI4Q0120 1917 nt1.33□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 RBK1YCR036W 1002 nt1.33□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.33□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 LSO2YGR169C-A 279 nt1.33□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YIL102CYIL102C 306 nt1.33□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 COA6YMR244C-A 315 nt1.33□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YNL226WYNL226W 411 nt1.33□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 EGD1YPL037C 474 nt1.33□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 KAR3YPR141C 2190 nt1.32□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 snR83snR83 306 nt1.32□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 CDC36YDL165W 576 nt1.32□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YGR228WYGR228W 345 nt1.32□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YLR366WYLR366W 306 nt1.32□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.32□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.32□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 NCA2YPR155C 1851 nt1.31□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YJR098CYJR098C 1971 nt1.31□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YDL041WYDL041W 354 nt1.31□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 MND1YGL183C 660 nt1.31□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt1.31□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.31□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt1.31□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 RVS161YCR009C 798 nt1.3□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.3□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YJL015CYJL015C 285 nt1.3□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YLR140WYLR140W 327 nt1.3□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 CGI121YML036W 546 nt1.3□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 REF2YDR195W 1602 nt1.29□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 SPC98YNL126W 2541 nt1.29□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 TIM10YHR005C-A 282 nt1.29□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.29□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 ATP20YPR020W 348 nt1.29□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 GNT1YOR320C 1476 nt1.29□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 CAT8YMR280C 4302 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 snR9snR9 187 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YGL015CYGL015C 393 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YGL024WYGL024W 336 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 PFD1YJL179W 330 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YOL159CYOL159C 516 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 FMP23YBR047W 528 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 YPR096CYPR096C 303 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 RSM22YKL155C 1887 nt1.28□□□□□ -2.2
MSH5Q12175 ALK1YGL021W 2283 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 MLH3YPL164C 2148 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YJL022WYJL022W 309 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 ECM9YKR004C 1134 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YPL197CYPL197C 414 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 CSM4YPL200W 471 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YBR063CYBR063C 1215 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 NUP120YKL057C 3114 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 EST2YLR318W 2655 nt1.27□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YBR184WYBR184W 1572 nt1.26□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 ABM1YJR108W 372 nt1.26□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YPR147CYPR147C 915 nt1.26□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 RAD9YDR217C 3930 nt1.26□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YGR283CYGR283C 1026 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 COF1YLL050C 432 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 GRX5YPL059W 453 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 KAP122YGL016W 3246 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 NUP192YJL039C 5052 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 SFB2YNL049C 2631 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 TRM3YDL112W 4311 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 DOT6YER088C 2013 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 UTP13YLR222C 2454 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 VPS52YDR484W 1926 nt1.25□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 SWT1YOR166C 1377 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 LRP1YHR081W 555 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 CRG1YHR209W 876 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 VPS55YJR044C 423 nt1.24□□□□□ -2.21
MSH5Q12175 YKL111CYKL111C 336 nt1.24□□□□□ -2.21
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