Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 PRK1YIL095W 2433 nt3.08□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 AMS1YGL156W 3252 nt3.07□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 RRP6YOR001W 2202 nt3.07□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 ESL2YKR096W 3588 nt3.07□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 VPS35YJL154C 2835 nt3.07□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 RTT10YPL183C 3042 nt3.07□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 BFA1YJR053W 1725 nt3.07□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 ECM29YHL030W 5607 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 RPS22AYJL190C 393 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 RPS27AYKL156W 249 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 MRPL33YMR286W 261 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 YBR277CYBR277C 402 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 TOP2YNL088W 4287 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 ISW1YBR245C 3390 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 DIS3YOL021C 3006 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 YEL043WYEL043W 2871 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 INP51YIL002C 2841 nt3.06□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 SMD1YGR074W 441 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 RPL14BYHL001W 417 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 NUP120YKL057C 3114 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 BUB1YGR188C 3066 nt3.05□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 YPP1YGR198W 2454 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 NFT1YKR103W 3657 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 STE5YDR103W 2754 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 GIS1YDR096W 2685 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 SUL1YBR294W 2580 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 YGR050CYGR050C 357 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 NOP10YHR072W-A 177 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 YPR099CYPR099C 357 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 PTP3YER075C 2787 nt3.04□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 RIC1YLR039C 3171 nt3.03□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 AFI1YOR129C 2682 nt3.03□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 RPS29AYLR388W 171 nt3.03□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 HSC82YMR186W 2118 nt3.03□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 SMY2YBR172C 2223 nt3.03□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 RKM1YPL208W 1752 nt3.02□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 SLN1YIL147C 3663 nt3.02□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 CRM1YGR218W 3255 nt3.02□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YCR022CYCR022C 345 nt3.02□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 PNC1YGL037C 651 nt3.02□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 HCH1YNL281W 462 nt3.02□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 VMA9YCL005W-A 222 nt3.02□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt3.02□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 PDR3YBL005W 2931 nt3.02□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 SNF5YBR289W 2718 nt3.01□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 INP52YNL106C 3552 nt3.01□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 snR70snR70 164 nt3.01□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt3.01□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 SGO1YOR073W 1773 nt3.01□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 SMY1YKL079W 1971 nt3.01□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 FAR11YNL127W 2862 nt3.01□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 FKS3YMR306W 5358 nt3.01□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 TOF2YKR010C 2316 nt3.01□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YNL018CYNL018C 1839 nt3□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 RBK1YCR036W 1002 nt3□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt3□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt3□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 DFG16YOR030W 1860 nt3□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 CBF2YGR140W 2871 nt3□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 PDR1YGL013C 3207 nt3□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 NOT5YPR072W 1683 nt2.99□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 TOM1YDR457W 9807 nt2.99□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 SWA2YDR320C 2007 nt2.99□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.99□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YAR029WYAR029W 225 nt2.99□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.99□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 MOT1YPL082C 5604 nt2.99□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 MRD1YPR112C 2664 nt2.99□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YKU80YMR106C 1890 nt2.99□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 PAN3YKL025C 2040 nt2.98□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 ALK2YBL009W 2031 nt2.97□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 SEC7YDR170C 6030 nt2.97□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 SNC1YAL030W 354 nt2.97□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 snR43snR43 209 nt2.97□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 NEW1YPL226W 3591 nt2.97□□□□□ -1.93
SSF2Q12153 YIL059CYIL059C 366 nt2.96□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 RPL32YBL092W 393 nt2.96□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 PFF1YBR074W 2931 nt2.96□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 ESL1YIL151C 3357 nt2.96□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 ORC2YBR060C 1863 nt2.96□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 KRE33YNL132W 3171 nt2.96□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YER138CYER138C 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YER160CYER160C 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YJR027WYJR027W 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YML039WYML039W 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
SSF2Q12153 YML045WYML045W 5268 nt2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.5 ms