Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 HOP2YGL033W 657 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YPR146CYPR146C 330 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 DAD3YBR233W-A 285 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 GPX2YBR244W 489 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 MET18YIL128W 3099 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 NAB6YML117W 3405 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 SSD1YDR293C 3753 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 SEC16YPL085W 6588 nt2.2□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 APL5YPL195W 2799 nt2.19□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 IES5YER092W 378 nt2.19□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YFL019CYFL019C 354 nt2.19□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 AGA2YGL032C 264 nt2.19□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 PEX4YGR133W 552 nt2.19□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 PSY1YKL076C 384 nt2.19□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 ZEO1YOL109W 342 nt2.19□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 CDC24YAL041W 2565 nt2.19□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 NOT5YPR072W 1683 nt2.18□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 SAP190YKR028W 3102 nt2.18□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 CDC60YPL160W 3273 nt2.18□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 CDC27YBL084C 2277 nt2.18□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YDR286CYDR286C 345 nt2.18□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YGL069CYGL069C 465 nt2.18□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 FCF2YLR051C 654 nt2.18□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 CHC1YGL206C 4962 nt2.18□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YGL024WYGL024W 336 nt2.17□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.17□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 SNF5YBR289W 2718 nt2.16□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 BNI1YNL271C 5862 nt2.16□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 USO1YDL058W 5373 nt2.16□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 RRF1YHR038W 693 nt2.16□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 URM1YIL008W 300 nt2.16□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 NFU1YKL040C 771 nt2.16□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 MGM1YOR211C 2646 nt2.16□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 RTT101YJL047C 2529 nt2.16□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 KOG1YHR186C 4674 nt2.15□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 MNL2YLR057W 2550 nt2.15□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 RUD3YOR216C 1455 nt2.15□□□□□ -2.06
NMD4Q12129 YPR097WYPR097W 3222 nt2.15□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.15□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.15□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.15□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 VMA9YCL005W-A 222 nt2.15□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 STB4YMR019W 2850 nt2.15□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 LYS9YNR050C 1341 nt2.15□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 INO80YGL150C 4470 nt2.14□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 DNF1YER166W 4716 nt2.14□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YOL098CYOL098C 3114 nt2.14□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.14□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 TMA22YJR014W 597 nt2.14□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 HSK3YKL138C-A 210 nt2.14□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.14□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YLR149CYLR149C 2193 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 VPS8YAL002W 3825 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 TFC3YAL001C 3483 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YDR341CYDR341C 1824 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 SMY1YKL079W 1971 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 ERP4YOR016C 624 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YBR224WYBR224W 516 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 SCH9YHR205W 2475 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 SET2YJL168C 2202 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 IST2YBR086C 2841 nt2.13□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 DOT6YER088C 2013 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YDL062WYDL062W 426 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 QCR7YDR529C 384 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 VTC1YER072W 390 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YLR053CYLR053C 327 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YLR287CYLR287C 1068 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YML084WYML084W 309 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 STH1YIL126W 4080 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 MKT1YNL085W 2493 nt2.12□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 DIE2YGR227W 1578 nt2.11□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 PET309YLR067C 2898 nt2.11□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.11□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.11□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 PEP3YLR148W 2757 nt2.11□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 NAM7YMR080C 2916 nt2.11□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 UTP22YGR090W 3714 nt2.11□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 TOF1YNL273W 3717 nt2.11□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.1□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 RTT107YHR154W 3213 nt2.1□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 RPL37BYDR500C 267 nt2.1□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.1□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 SYH1YPL105C 2550 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 SAP185YJL098W 3177 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 MCD1YDL003W 1701 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 IRC8YJL051W 2469 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 RBK1YCR036W 1002 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 CBS1YDL069C 690 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 SDH7YDR511W 402 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YBL083CYBL083C 426 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YOL159CYOL159C 516 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 YOR392WYOR392W 444 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 SLM1YIL105C 2061 nt2.09□□□□□ -2.07
NMD4Q12129 UFD4YKL010C 4452 nt2.09□□□□□ -2.08
NMD4Q12129 YBR184WYBR184W 1572 nt2.08□□□□□ -2.08
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