Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 YOR333CYOR333C 417 nt4.47□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 MTC4YBR255W 2085 nt4.47□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 FLO10YKR102W 3510 nt4.46□□□□□ -1.69
NOP53Q12080 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt4.46□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 BRP1YGL007W 378 nt4.46□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 USE1YGL098W 738 nt4.46□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 RAM2YKL019W 951 nt4.46□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 TIM12YBR091C 330 nt4.46□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 YEL043WYEL043W 2871 nt4.46□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 MSH2YOL090W 2895 nt4.46□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 RNR1YER070W 2667 nt4.46□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 TMA108YIL137C 2841 nt4.45□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 MTR4YJL050W 3222 nt4.45□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 PAN3YKL025C 2040 nt4.45□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 APC11YDL008W 498 nt4.45□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 SBH1YER087C-B 249 nt4.45□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 YIR044CYIR044C 186 nt4.45□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 YJL022WYJL022W 309 nt4.45□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 YLR352WYLR352W 2424 nt4.44□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 CCM1YGR150C 2595 nt4.44□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 snR61snR61 90 nt4.44□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 RPL25YOL127W 429 nt4.44□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 ACM1YPL267W 630 nt4.44□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 RPB2YOR151C 3675 nt4.44□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 HFM1YGL251C 3564 nt4.44□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 SSQ1YLR369W 1974 nt4.44□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 SWH1YAR042W 3567 nt4.43□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 YGR051CYGR051C 324 nt4.43□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 RPL6AYML073C 531 nt4.43□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt4.43□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 ERB1YMR049C 2424 nt4.43□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 RLM1YPL089C 2031 nt4.43□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 RTC6YPL183W-A 282 nt4.42□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 SEC15YGL233W 2733 nt4.41□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 TMA19YKL056C 504 nt4.41□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 HEH2YDR458C 1992 nt4.41□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 APE2YKL157W 2859 nt4.41□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 DUF1YOL087C 3351 nt4.4□□□□□ -1.7
NOP53Q12080 PAU10YDR542W 363 nt4.4□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YMR31YFR049W 372 nt4.4□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 PAU11YGL261C 363 nt4.4□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 PAU4YLR461W 363 nt4.4□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 COY1YKL179C 2040 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YER053C-AYER053C-A 114 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YOR218CYOR218C 420 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YBR099CYBR099C 384 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 DBP7YKR024C 2229 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YDR341CYDR341C 1824 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 TOP1YOL006C 2310 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YJL070CYJL070C 2667 nt4.39□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 SSM4YIL030C 3960 nt4.38□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 CLN3YAL040C 1743 nt4.38□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 RIX1YHR197W 2292 nt4.38□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YPR022CYPR022C 3402 nt4.38□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 SPT6YGR116W 4356 nt4.38□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YBL065WYBL065W 345 nt4.38□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 EFR3YMR212C 2349 nt4.38□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 MPT5YGL178W 2580 nt4.37□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 RAD2YGR258C 3096 nt4.37□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YOR102WYOR102W 351 nt4.37□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 COS111YBR203W 2775 nt4.37□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt4.36□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YFL065CYFL065C 309 nt4.36□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt4.36□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 SIR3YLR442C 2937 nt4.36□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 PSO2YMR137C 1986 nt4.36□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 BCH1YMR237W 2175 nt4.36□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 ALA1YOR335C 2877 nt4.35□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 PHM6YDR281C 315 nt4.35□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 EXO84YBR102C 2262 nt4.35□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 BMS1YPL217C 3552 nt4.35□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 RLI1YDR091C 1827 nt4.35□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt4.34□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 MCM10YIL150C 1716 nt4.34□□□□□ -1.71
NOP53Q12080 SGD1YLR336C 2700 nt4.33□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 YAK1YJL141C 2424 nt4.33□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 AKR1YDR264C 2295 nt4.33□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt4.33□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 REG1YDR028C 3045 nt4.32□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 INP2YMR163C 2118 nt4.32□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 PTC5YOR090C 1719 nt4.32□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 VBA4YDR119W 2307 nt4.32□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 PUF4YGL014W 2667 nt4.31□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 FLO9YAL063C 3969 nt4.31□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt4.31□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 NTO1YPR031W 2247 nt4.3□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 VPH1YOR270C 2523 nt4.3□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 CHD1YER164W 4407 nt4.3□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt4.3□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 GIS4YML006C 2325 nt4.3□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 TRS120YDR407C 3870 nt4.3□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 RPO31YOR116C 4383 nt4.29□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 ITC1YGL133W 3795 nt4.29□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 FAR1YJL157C 2493 nt4.29□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 SYT1YPR095C 3681 nt4.28□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 MET10YFR030W 3108 nt4.28□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 TIM11YDR322C-A 291 nt4.28□□□□□ -1.72
NOP53Q12080 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61 ms