Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC63Q05C16 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC63Q05C16 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms