Protein–RNA interactions for Protein: Q05947

YLR224W, F-box protein YLR224W, yeastyeast

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR224WQ05947 DYN2YDR424C 279 nt2.84□□□□□ -1.95
YLR224WQ05947 RAD2YGR258C 3096 nt2.84□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 TAO3YIL129C 7131 nt2.83□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 PDE2YOR360C 1581 nt2.83□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 DUF1YOL087C 3351 nt2.83□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 YJL070CYJL070C 2667 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 IES6YEL044W 501 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 VTC1YER072W 390 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 YGL217CYGL217C 342 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 SMD1YGR074W 441 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 YLR255CYLR255C 354 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 RTC6YPL183W-A 282 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 DIA2YOR080W 2199 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 IPT1YDR072C 1584 nt2.82□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 SOK1YDR006C 2706 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 NUP120YKL057C 3114 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 PSK2YOL045W 3306 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 ITC1YGL133W 3795 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 SSS1YDR086C 243 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 FPR1YNL135C 345 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 NUT2YPR168W 474 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 LRE1YCL051W 1752 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 NOP4YPL043W 2058 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 CDC27YBL084C 2277 nt2.81□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 POM152YMR129W 4014 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 ATG13YPR185W 2217 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 GUP1YGL084C 1683 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 PRE4YFR050C 801 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 ERP6YGL002W 651 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 TRX1YLR043C 312 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 RPS28BYLR264W 204 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 YOR376WYOR376W 369 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 RIF1YBR275C 5751 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 ALK2YBL009W 2031 nt2.8□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 RLI1YDR091C 1827 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 NPR3YHL023C 3441 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 INA22YIR024C 651 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 YPR092WYPR092W 306 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 PAN3YKL025C 2040 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 FUN30YAL019W 3396 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 SEC5YDR166C 2916 nt2.79□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 DBP7YKR024C 2229 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 MDV1YJL112W 2145 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 TOF2YKR010C 2316 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 GIS4YML006C 2325 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 snR46snR46 197 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 snR52snR52 92 nt2.78□□□□□ -1.96
YLR224WQ05947 PUF4YGL014W 2667 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 HSC82YMR186W 2118 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 PMR1YGL167C 2853 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 VPS53YJL029C 2469 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 SGD1YLR336C 2700 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 TFC4YGR047C 3078 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 TMN3YER113C 2121 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YHR080CYHR080C 4038 nt2.77□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 INP52YNL106C 3552 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 BCH1YMR237W 2175 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YDR286CYDR286C 345 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 RPL22AYLR061W 366 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 LSM7YNL147W 348 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YOR333CYOR333C 417 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 ESL1YIL151C 3357 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 KAP104YBR017C 2757 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 MPH1YIR002C 2982 nt2.76□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 SAK1YER129W 3429 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 CUL3YGR003W 2235 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YDL242WYDL242W 354 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 GRX8YLR364W 330 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 SNC2YOR327C 348 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 TRM2YKR056W 1920 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YOL057WYOL057W 2136 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YLR278CYLR278C 4026 nt2.75□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 CFT2YLR115W 2580 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 MET5YJR137C 4329 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 VPS54YDR027C 2670 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 APC9YLR102C 798 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YML037CYML037C 1023 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YAT2YER024W 2772 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 SNQ2YDR011W 4506 nt2.74□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 snR74snR74 88 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 RPS27BYHR021C 249 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 SPT21YMR179W 2277 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 BAS1YKR099W 2436 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 NAB3YPL190C 2409 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 COP1YDL145C 3606 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 EPL1YFL024C 2499 nt2.73□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 BUD4YJR092W 4344 nt2.72□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 PEX8YGR077C 1770 nt2.72□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 CHO2YGR157W 2610 nt2.72□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 VMA9YCL005W-A 222 nt2.72□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 ORC1YML065W 2745 nt2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.2 ms