Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMB2P55268 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMB2P55268 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms