Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 EGD1YPL037C 474 nt2.21□□□□□ -2.06
SEF1P34228 DAD3YBR233W-A 285 nt2.21□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YSW1YBR148W 1830 nt2.21□□□□□ -2.06
SEF1P34228 AFI1YOR129C 2682 nt2.21□□□□□ -2.06
SEF1P34228 APL5YPL195W 2799 nt2.21□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.2□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.2□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YLR255CYLR255C 354 nt2.2□□□□□ -2.06
SEF1P34228 RPS18BYML026C 441 nt2.2□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YOR055WYOR055W 435 nt2.2□□□□□ -2.06
SEF1P34228 KAR3YPR141C 2190 nt2.2□□□□□ -2.06
SEF1P34228 REV3YPL167C 4515 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 MMS22YLR320W 4365 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 TOF1YNL273W 3717 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 MET18YIL128W 3099 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 RAV1YJR033C 4074 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YER079WYER079W 633 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 TMA22YJR014W 597 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 SNC2YOR327C 348 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 LEE1YPL054W 906 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YPR012WYPR012W 255 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 KAP123YER110C 3342 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 CLN3YAL040C 1743 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 ARP8YOR141C 2646 nt2.19□□□□□ -2.06
SEF1P34228 STH1YIL126W 4080 nt2.18□□□□□ -2.06
SEF1P34228 MSS11YMR164C 2277 nt2.18□□□□□ -2.06
SEF1P34228 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.18□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.18□□□□□ -2.06
SEF1P34228 MKT1YNL085W 2493 nt2.18□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YOL098CYOL098C 3114 nt2.18□□□□□ -2.06
SEF1P34228 NUP170YBL079W 4509 nt2.18□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YDR157WYDR157W 402 nt2.17□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.17□□□□□ -2.06
SEF1P34228 FCF2YLR051C 654 nt2.17□□□□□ -2.06
SEF1P34228 TMN3YER113C 2121 nt2.17□□□□□ -2.06
SEF1P34228 SOK2YMR016C 2358 nt2.16□□□□□ -2.06
SEF1P34228 SPO23YBR250W 1572 nt2.16□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.16□□□□□ -2.06
SEF1P34228 UBC7YMR022W 498 nt2.16□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YOL159CYOL159C 516 nt2.16□□□□□ -2.06
SEF1P34228 PHO91YNR013C 2685 nt2.16□□□□□ -2.06
SEF1P34228 CRM1YGR218W 3255 nt2.16□□□□□ -2.06
SEF1P34228 SWR1YDR334W 4545 nt2.16□□□□□ -2.06
SEF1P34228 SGD1YLR336C 2700 nt2.15□□□□□ -2.06
SEF1P34228 MSB1YOR188W 3414 nt2.15□□□□□ -2.06
SEF1P34228 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.15□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YHR138CYHR138C 345 nt2.15□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.15□□□□□ -2.07
SEF1P34228 URM1YIL008W 300 nt2.15□□□□□ -2.07
SEF1P34228 ATP7YKL016C 525 nt2.15□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YPR146CYPR146C 330 nt2.15□□□□□ -2.07
SEF1P34228 IST2YBR086C 2841 nt2.14□□□□□ -2.07
SEF1P34228 SIR4YDR227W 4077 nt2.14□□□□□ -2.07
SEF1P34228 SDH7YDR511W 402 nt2.14□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.14□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YLR334CYLR334C 381 nt2.14□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YML084WYML084W 309 nt2.14□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YOR333CYOR333C 417 nt2.14□□□□□ -2.07
SEF1P34228 GIP3YPL137C 3831 nt2.14□□□□□ -2.07
SEF1P34228 BNI1YNL271C 5862 nt2.14□□□□□ -2.07
SEF1P34228 STB4YMR019W 2850 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 SEC16YPL085W 6588 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 RIC1YLR039C 3171 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 PUT3YKL015W 2940 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 VPH1YOR270C 2523 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YDR269CYDR269C 324 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YDR286CYDR286C 345 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 RPL27BYDR471W 411 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YGL024WYGL024W 336 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YGL069CYGL069C 465 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YLR287CYLR287C 1068 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 MRPL50YNR022C 420 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 VMA9YCL005W-A 222 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 CDC27YBL084C 2277 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 DIE2YGR227W 1578 nt2.13□□□□□ -2.07
SEF1P34228 RTT107YHR154W 3213 nt2.12□□□□□ -2.07
SEF1P34228 CBS1YDL069C 690 nt2.12□□□□□ -2.07
SEF1P34228 GIM4YEL003W 336 nt2.12□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.12□□□□□ -2.07
SEF1P34228 GPX2YBR244W 489 nt2.12□□□□□ -2.07
SEF1P34228 MGM1YOR211C 2646 nt2.12□□□□□ -2.07
SEF1P34228 MNE1YOR350C 1992 nt2.12□□□□□ -2.07
SEF1P34228 SWF1YDR126W 1011 nt2.11□□□□□ -2.07
SEF1P34228 RPS24AYER074W 408 nt2.11□□□□□ -2.07
SEF1P34228 RPS24BYIL069C 408 nt2.11□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YPL261CYPL261C 309 nt2.11□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.11□□□□□ -2.07
SEF1P34228 RUD3YOR216C 1455 nt2.11□□□□□ -2.07
SEF1P34228 SMC6YLR383W 3345 nt2.1□□□□□ -2.07
SEF1P34228 RTT101YJL047C 2529 nt2.1□□□□□ -2.07
SEF1P34228 QCR7YDR529C 384 nt2.1□□□□□ -2.07
SEF1P34228 HOP2YGL033W 657 nt2.1□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YPL185WYPL185W 396 nt2.1□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YBR285WYBR285W 435 nt2.1□□□□□ -2.07
SEF1P34228 TRL1YJL087C 2484 nt2.1□□□□□ -2.07
SEF1P34228 SCD5YOR329C 2619 nt2.09□□□□□ -2.07
SEF1P34228 YLR149CYLR149C 2193 nt2.09□□□□□ -2.07
SEF1P34228 VPS13YLL040C 9435 nt2.09□□□□□ -2.07
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