Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E1P29083 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E1P29083 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms