Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BEST4Q8NFU0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BEST4Q8NFU0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms