Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD1Q15797 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD1Q15797 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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