Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTP4A2Q12974 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTP4A2Q12974 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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