Protein–RNA interactions for Protein: Q12472

TY2B-DR1, Transposon Ty2-DR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-DR1Q12472 SRL4YPL033C 846 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 WAR1YML076C 2835 nt0.41□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 LYS14YDR034C 2373 nt0.41□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 MUB1YMR100W 1863 nt0.4□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 MUM3YOR298W 1440 nt0.4□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 MVP1YMR004W 1536 nt0.4□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 DGR2YKL121W 2559 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YFR056CYFR056C 369 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 MRPL25YGR076C 474 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 PRS3YHL011C 963 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 CMC2YBL059C-A 330 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 snR45snR45 172 nt0.39□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 SNA4YDL123W 423 nt0.38□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 EDC1YGL222C 528 nt0.38□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 DSE2YHR143W 978 nt0.38□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 HYR1YIR037W 492 nt0.38□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 ABM1YJR108W 372 nt0.38□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 SPC42YKL042W 1092 nt0.38□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YDR042CYDR042C 603 nt0.37□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 RMD5YDR255C 1266 nt0.37□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt0.37□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YGL118CYGL118C 438 nt0.37□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YLL007CYLL007C 1998 nt0.37□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YLL054CYLL054C 2532 nt0.37□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YCR015CYCR015C 954 nt0.36□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YLR290CYLR290C 834 nt0.36□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 MER1YNL210W 813 nt0.36□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 MRPL40YPL173W 894 nt0.36□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YGR250CYGR250C 2346 nt0.36□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 ECM11YDR446W 909 nt0.35□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.35□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 RPL38YLR325C 237 nt0.35□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 CYB5YNL111C 363 nt0.35□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YDR248CYDR248C 582 nt0.34□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 YGL138CYGL138C 1038 nt0.34□□□□□ -2.35
TY2B-DR1Q12472 RRG1YDR065W 1098 nt0.34□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 HOP2YGL033W 657 nt0.34□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YHR022CYHR022C 771 nt0.34□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 SEC22YLR268W 645 nt0.34□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 RPL6BYLR448W 531 nt0.34□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 LSM7YNL147W 348 nt0.34□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 SMB1YER029C 591 nt0.33□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 SRP21YKL122C 504 nt0.33□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 RPL9AYGL147C 576 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 TAN1YGL232W 870 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YMR178WYMR178W 825 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 UAF30YOR295W 687 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 PHO92YDR374C 921 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 ICS2YBR157C 768 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 SMY1YKL079W 1971 nt0.32□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 URB1YKL014C 5295 nt0.31□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YDR286CYDR286C 345 nt0.31□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.31□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 RIM20YOR275C 1986 nt0.31□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 CDC5YMR001C 2118 nt0.31□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 SLU7YDR088C 1149 nt0.3□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 MEI4YER044C-A 1227 nt0.3□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 COF1YLL050C 432 nt0.3□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 COBQ0105 1158 nt0.29□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YGR114CYGR114C 390 nt0.29□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 ADF1YCL058W-A 342 nt0.29□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 NUP188YML103C 4968 nt0.29□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YET2YMR040W 483 nt0.29□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 NGG1YDR176W 2109 nt0.28□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 IRC14YOR135C 342 nt0.28□□□□□ -2.36
TY2B-DR1Q12472 YAR053WYAR053W 297 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 FYV6YNL133C 522 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 YBL077WYBL077W 432 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 YNR068CYNR068C 819 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 PRM8YGL053W 714 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 SAY1YGR263C 1275 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 YIL012WYIL012W 342 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 BET5YML077W 480 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 PFK27YOL136C 1194 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 SFM1YOR021C 642 nt0.27□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 ESP1YGR098C 4893 nt0.26□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 AIM9YER080W 1884 nt0.25□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 SLY1YDR189W 2001 nt0.25□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 SWT1YOR166C 1377 nt0.25□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 MZM1YDR493W 372 nt0.25□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 SGD1YLR336C 2700 nt0.25□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 IRC23YOR044W 474 nt0.24□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 YOR376WYOR376W 369 nt0.24□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 SWS2YNL081C 432 nt0.24□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 GRX7YBR014C 612 nt0.24□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 STB6YKL072W 2301 nt0.23□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 ECM12YHR021W-A 456 nt0.23□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 YIL141WYIL141W 390 nt0.23□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 RRP15YPR143W 753 nt0.23□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 DSE1YER124C 1722 nt0.23□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 RPB5YBR154C 648 nt0.22□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 BPH1YCR032W 6504 nt0.22□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.22□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 YMR147WYMR147W 672 nt0.22□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 YPR014CYPR014C 330 nt0.22□□□□□ -2.37
TY2B-DR1Q12472 SRB4YER022W 2064 nt0.21□□□□□ -2.38
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