Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 FAR7YFR008W 666 nt1.39□□□□□ -2.19
USB1Q12208 MND1YGL183C 660 nt1.39□□□□□ -2.19
USB1Q12208 TAD1YGL243W 1203 nt1.39□□□□□ -2.19
USB1Q12208 TAP42YMR028W 1101 nt1.39□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.39□□□□□ -2.19
USB1Q12208 NAN1YPL126W 2691 nt1.39□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SXM1YDR395W 2835 nt1.39□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SSK2YNR031C 4740 nt1.38□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YDL009CYDL009C 324 nt1.38□□□□□ -2.19
USB1Q12208 RPL31AYDL075W 342 nt1.38□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YNL150WYNL150W 408 nt1.38□□□□□ -2.19
USB1Q12208 RKM1YPL208W 1752 nt1.38□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SEY1YOR165W 2331 nt1.38□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YJR098CYJR098C 1971 nt1.38□□□□□ -2.19
USB1Q12208 PIK1YNL267W 3201 nt1.37□□□□□ -2.19
USB1Q12208 FRK1YPL141C 2598 nt1.37□□□□□ -2.19
USB1Q12208 GPM2YDL021W 936 nt1.37□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SNO3YFL060C 669 nt1.37□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt1.37□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SNO2YNL334C 669 nt1.37□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.37□□□□□ -2.19
USB1Q12208 ATP20YPR020W 348 nt1.37□□□□□ -2.19
USB1Q12208 MMS22YLR320W 4365 nt1.37□□□□□ -2.19
USB1Q12208 KIP1YBL063W 3336 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YER038W-AYER038W-A 381 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 TRX1YLR043C 312 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YLR458WYLR458W 381 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 COA6YMR244C-A 315 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 NUP192YJL039C 5052 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SLM1YIL105C 2061 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 RRI2YOL117W 1938 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 APM3YBR288C 1452 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SPO22YIL073C 2928 nt1.36□□□□□ -2.19
USB1Q12208 snR9snR9 187 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YGL024WYGL024W 336 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SMD1YGR074W 441 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 ANS1YHR126C 480 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 AIM18YHR198C 966 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YIL102CYIL102C 306 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 IST3YIR005W 447 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 RPS7BYNL096C 573 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 MGR1YCL044C 1254 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SKI3YPR189W 4299 nt1.35□□□□□ -2.19
USB1Q12208 CTF4YPR135W 2784 nt1.34□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YBP1YBR216C 2025 nt1.34□□□□□ -2.19
USB1Q12208 SFB2YNL049C 2631 nt1.34□□□□□ -2.19
USB1Q12208 RPL29YFR032C-A 180 nt1.34□□□□□ -2.19
USB1Q12208 ARV1YLR242C 966 nt1.34□□□□□ -2.19
USB1Q12208 CYB5YNL111C 363 nt1.34□□□□□ -2.19
USB1Q12208 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.34□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.34□□□□□ -2.2
USB1Q12208 NOP53YPL146C 1368 nt1.34□□□□□ -2.2
USB1Q12208 RBK1YCR036W 1002 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YFL012WYFL012W 447 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YGR228WYGR228W 345 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YJR087WYJR087W 351 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 CSI1YMR025W 888 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 SPC29YPL124W 762 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 CAT8YMR280C 4302 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 CCH1YGR217W 6120 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 COX1Q0045 1605 nt1.33□□□□□ -2.2
USB1Q12208 BRO1YPL084W 2535 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 ADR1YDR216W 3972 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YSW1YBR148W 1830 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YDR042CYDR042C 603 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YGL069CYGL069C 465 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YHR054CYHR054C 1065 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 TPM2YIL138C 486 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YHC1YLR298C 696 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 GRX8YLR364W 330 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YBR174CYBR174C 315 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 REF2YDR195W 1602 nt1.32□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.31□□□□□ -2.2
USB1Q12208 RPI1YIL119C 1224 nt1.31□□□□□ -2.2
USB1Q12208 HSK3YKL138C-A 210 nt1.31□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YOR105WYOR105W 327 nt1.31□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YPR177CYPR177C 372 nt1.31□□□□□ -2.2
USB1Q12208 IRE1YHR079C 3348 nt1.31□□□□□ -2.2
USB1Q12208 DPB11YJL090C 2295 nt1.31□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 BNA7YDR428C 786 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YHL037CYHL037C 402 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 BET4YJL031C 984 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 TIM8YJR135W-A 264 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 LCL2YLR104W 396 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YOR364WYOR364W 369 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 CSM4YPL200W 471 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 YPR096CYPR096C 303 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 PLC1YPL268W 2610 nt1.3□□□□□ -2.2
USB1Q12208 RIC1YLR039C 3171 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 HIR3YJR140C 4947 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 TMA20YER007C-A 546 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 RNR4YGR180C 1038 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 RCN1YKL159C 636 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 ECM9YKR004C 1134 nt1.29□□□□□ -2.2
USB1Q12208 URA10YMR271C 684 nt1.29□□□□□ -2.2
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