Protein–RNA interactions for Protein: Q08957

AFT2, Iron-regulated transcriptional activator AFT2, yeastyeast

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFT2Q08957 RPL35AYDL191W 363 nt2.85□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 YGR164WYGR164W 336 nt2.85□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 RPC10YHR143W-A 213 nt2.85□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 BAT1YHR208W 1182 nt2.85□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 RPL40AYIL148W 387 nt2.85□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 GPI14YJR013W 1212 nt2.85□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 TMA22YJR014W 597 nt2.85□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 RAD61YDR014W 1944 nt2.85□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 TCP1YDR212W 1680 nt2.85□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 VPS64YDR200C 1815 nt2.84□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 NET1YJL076W 3570 nt2.84□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 URM1YIL008W 300 nt2.84□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 HSP10YOR020C 321 nt2.84□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 NTC20YBR188C 423 nt2.84□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 SLM6YBR266C 453 nt2.84□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 TOM1YDR457W 9807 nt2.84□□□□□ -1.95
AFT2Q08957 KEL2YGR238C 2649 nt2.84□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 SNX41YDR425W 1878 nt2.84□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 BCK1YJL095W 4437 nt2.84□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 ICR1ICR1 3199 nt2.84□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 RTT10YPL183C 3042 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 HTL1YCR020W-B 237 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 CSN9YDR179C 489 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 COF1YLL050C 432 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 RPL16BYNL069C 597 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YBL083CYBL083C 426 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YCL019WYCL019W 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 DIA2YOR080W 2199 nt2.83□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 SEC26YDR238C 2922 nt2.82□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 PCF11YDR228C 1881 nt2.82□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 SMC2YFR031C 3513 nt2.82□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YDR338CYDR338C 2088 nt2.82□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.82□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YIL032CYIL032C 357 nt2.82□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YBR197CYBR197C 654 nt2.82□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YKL100CYKL100C 1764 nt2.82□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 GIS4YML006C 2325 nt2.81□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.81□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 HSK3YKL138C-A 210 nt2.81□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YPL080CYPL080C 327 nt2.81□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 ATP22YDR350C 2055 nt2.81□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 KIN82YCR091W 2163 nt2.81□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 ESL2YKR096W 3588 nt2.81□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 BNR1YIL159W 4128 nt2.81□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 PDR1YGL013C 3207 nt2.8□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.8□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.8□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 GPG1YGL121C 381 nt2.8□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 RPS22BYLR367W 393 nt2.8□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.8□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 RPL23AYBL087C 414 nt2.8□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YOR055WYOR055W 435 nt2.8□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 BNI4YNL233W 2679 nt2.8□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 SRP68YPL243W 1800 nt2.79□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 GIN4YDR507C 3429 nt2.79□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 RPB11YOL005C 363 nt2.79□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.79□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 PRK1YIL095W 2433 nt2.79□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 TCB2YNL087W 3537 nt2.79□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 ARP8YOR141C 2646 nt2.78□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 CWH41YGL027C 2502 nt2.78□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 DBP6YNR038W 1890 nt2.78□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 snR55snR55 98 nt2.78□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 YGL052WYGL052W 306 nt2.78□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 RPS12YOR369C 432 nt2.78□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 SGO1YOR073W 1773 nt2.78□□□□□ -1.96
AFT2Q08957 VIK1YPL253C 1944 nt2.78□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YSW1YBR148W 1830 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 FLO11YIR019C 4104 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 RPO41YFL036W 4056 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YEL1YBL060W 2064 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 PDC2YDR081C 2778 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 CHS3YBR023C 3498 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YDR048CYDR048C 315 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 ERG28YER044C 447 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YLR140WYLR140W 327 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 LTP1YPR073C 486 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 MGR1YCL044C 1254 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 MAK21YDR060W 3078 nt2.77□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 MRD1YPR112C 2664 nt2.76□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 RPL34BYIL052C 366 nt2.76□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 PAU23YLR037C 375 nt2.76□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.76□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.76□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.76□□□□□ -1.97
AFT2Q08957 SAP1YER047C 2694 nt2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41 ms