Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

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Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 GIM3YNL153C 390 nt0.14□□□□□ -2.39
SSK2P53599 YOL050CYOL050C 321 nt0.14□□□□□ -2.39
SSK2P53599 MEI4YER044C-A 1227 nt0.13□□□□□ -2.39
SSK2P53599 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.13□□□□□ -2.39
SSK2P53599 UTP10YJL109C 5310 nt0.13□□□□□ -2.39
SSK2P53599 YSW1YBR148W 1830 nt0.12□□□□□ -2.39
SSK2P53599 DBP6YNR038W 1890 nt0.12□□□□□ -2.39
SSK2P53599 IRC23YOR044W 474 nt0.11□□□□□ -2.39
SSK2P53599 HLR1YDR528W 1272 nt0.11□□□□□ -2.39
SSK2P53599 LSM7YNL147W 348 nt0.11□□□□□ -2.39
SSK2P53599 NUP188YML103C 4968 nt0.1□□□□□ -2.39
SSK2P53599 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
SSK2P53599 SPC2YML055W 537 nt0.1□□□□□ -2.39
SSK2P53599 MON1YGL124C 1935 nt0.09□□□□□ -2.4
SSK2P53599 SWT1YOR166C 1377 nt0.08□□□□□ -2.4
SSK2P53599 UIP3YAR027W 708 nt0.07□□□□□ -2.4
SSK2P53599 YBL028CYBL028C 321 nt0.06□□□□□ -2.4
SSK2P53599 TOF2YKR010C 2316 nt0.06□□□□□ -2.4
SSK2P53599 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.06□□□□□ -2.4
SSK2P53599 YMR178WYMR178W 825 nt0.06□□□□□ -2.4
SSK2P53599 KDX1YKL161C 1302 nt0.05□□□□□ -2.4
SSK2P53599 CKA1YIL035C 1119 nt0.05□□□□□ -2.4
SSK2P53599 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.05□□□□□ -2.4
SSK2P53599 MZM1YDR493W 372 nt0.04□□□□□ -2.4
SSK2P53599 COF1YLL050C 432 nt0.04□□□□□ -2.4
SSK2P53599 STB6YKL072W 2301 nt0.04□□□□□ -2.4
SSK2P53599 YEL075CYEL075C 369 nt0.03□□□□□ -2.4
SSK2P53599 YER189WYER189W 369 nt0.03□□□□□ -2.4
SSK2P53599 YOR053WYOR053W 342 nt0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 NUT1YGL151W 3399 nt0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 COS7YDL248W 1152 nt0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 SNX4YJL036W 1272 nt0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 TSA2YDR453C 591 nt0.01□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.01□□□□□ -2.41
SSK2P53599 COX3Q0275 810 nt0.01□□□□□ -2.41
SSK2P53599 REX3YLR107W 1215 nt0.01□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YLR290CYLR290C 834 nt0.01□□□□□ -2.41
SSK2P53599 ATP18YML081C-A 180 nt0.01□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YJL049WYJL049W 1353 nt0.01□□□□□ -2.41
SSK2P53599 ECM12YHR021W-A 456 nt0□□□□□ -2.41
SSK2P53599 IRC19YLL033W 693 nt0□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YMR31YFR049W 372 nt-0.01□□□□□ -2.41
SSK2P53599 SDL1YIL167W 633 nt-0.01□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YDR042CYDR042C 603 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 REV7YIL139C 738 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 AFR1YDR085C 1863 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YCR108CYCR108C 192 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 GLC7YER133W 939 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 HOP2YGL033W 657 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YGR026WYGR026W 837 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YGR164WYGR164W 336 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YLR232WYLR232W 348 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSK2P53599 MKT1YNL085W 2493 nt-0.03□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YFR054CYFR054C 579 nt-0.03□□□□□ -2.41
SSK2P53599 YIL141WYIL141W 390 nt-0.03□□□□□ -2.41
SSK2P53599 RPL37AYLR185W 267 nt-0.03□□□□□ -2.41
SSK2P53599 LOA1YPR139C 903 nt-0.03□□□□□ -2.41
SSK2P53599 NYV1YLR093C 762 nt-0.04□□□□□ -2.42
SSK2P53599 SNC1YAL030W 354 nt-0.05□□□□□ -2.42
SSK2P53599 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.06□□□□□ -2.42
SSK2P53599 SLU7YDR088C 1149 nt-0.06□□□□□ -2.42
SSK2P53599 SFM1YOR021C 642 nt-0.06□□□□□ -2.42
SSK2P53599 YCR007CYCR007C 720 nt-0.06□□□□□ -2.42
SSK2P53599 YDL157CYDL157C 357 nt-0.06□□□□□ -2.42
SSK2P53599 CMC2YBL059C-A 330 nt-0.06□□□□□ -2.42
SSK2P53599 FYV6YNL133C 522 nt-0.06□□□□□ -2.42
SSK2P53599 BIT61YJL058C 1632 nt-0.07□□□□□ -2.42
SSK2P53599 VMA7YGR020C 357 nt-0.07□□□□□ -2.42
SSK2P53599 YLL020CYLL020C 306 nt-0.07□□□□□ -2.42
SSK2P53599 YLR400WYLR400W 474 nt-0.07□□□□□ -2.42
SSK2P53599 YGR219WYGR219W 342 nt-0.08□□□□□ -2.42
SSK2P53599 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt-0.08□□□□□ -2.42
SSK2P53599 SAG1YJR004C 1953 nt-0.08□□□□□ -2.42
SSK2P53599 YLR124WYLR124W 345 nt-0.09□□□□□ -2.42
SSK2P53599 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.1□□□□□ -2.42
SSK2P53599 SPT21YMR179W 2277 nt-0.1□□□□□ -2.43
SSK2P53599 RTR1YER139C 681 nt-0.11□□□□□ -2.43
SSK2P53599 RRT7YLL030C 342 nt-0.11□□□□□ -2.43
SSK2P53599 YOL150CYOL150C 312 nt-0.11□□□□□ -2.43
SSK2P53599 SMY1YKL079W 1971 nt-0.11□□□□□ -2.43
SSK2P53599 GDS1YOR355W 1569 nt-0.12□□□□□ -2.43
SSK2P53599 KAR3YPR141C 2190 nt-0.12□□□□□ -2.43
SSK2P53599 SWS2YNL081C 432 nt-0.12□□□□□ -2.43
SSK2P53599 SRL4YPL033C 846 nt-0.12□□□□□ -2.43
SSK2P53599 YPL073CYPL073C 486 nt-0.12□□□□□ -2.43
SSK2P53599 RAD34YDR314C 2079 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSK2P53599 YCR015CYCR015C 954 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSK2P53599 CYC7YEL039C 342 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSK2P53599 DSE2YHR143W 978 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSK2P53599 CYB5YNL111C 363 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSK2P53599 YNR077CYNR077C 255 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSK2P53599 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSK2P53599 UAF30YOR295W 687 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSK2P53599 VIK1YPL253C 1944 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSK2P53599 YPL034WYPL034W 498 nt-0.15□□□□□ -2.43
SSK2P53599 snR190snR190 190 nt-0.15□□□□□ -2.43
SSK2P53599 snR46snR46 197 nt-0.15□□□□□ -2.43
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