Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 DNF1YER166W 4716 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 CRG1YHR209W 876 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 PAU14YIL176C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 PAU1YJL223C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YLR031WYLR031W 561 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 ATP3YBR039W 936 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 DAD3YBR233W-A 285 nt2.38□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 IRC8YJL051W 2469 nt2.37□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 HOS4YIL112W 3252 nt2.37□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.37□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.37□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 TFC3YAL001C 3483 nt2.37□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 NIC96YFR002W 2520 nt2.36□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 ATP17YDR377W 306 nt2.36□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.36□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YPR012WYPR012W 255 nt2.36□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 RRP12YPL012W 3687 nt2.36□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 VTC3YPL019C 2508 nt2.36□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 VPS41YDR080W 2979 nt2.36□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 INP53YOR109W 3324 nt2.35□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 SAK1YER129W 3429 nt2.35□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 SNU114YKL173W 3027 nt2.35□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 UBP11YKR098C 2154 nt2.35□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YER079WYER079W 633 nt2.35□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.35□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 ACB1YGR037C 264 nt2.35□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 RRF1YHR038W 693 nt2.35□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.35□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 VPS52YDR484W 1926 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 APL5YPL195W 2799 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 CLN3YAL040C 1743 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 VPS16YPL045W 2397 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 SDC1YDR469W 528 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YFR056CYFR056C 369 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 HSC82YMR186W 2118 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 COX7YMR256C 183 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 ZEO1YOL109W 342 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 YOL159CYOL159C 516 nt2.34□□□□□ -2.03
YBL055CP34220 SAP190YKR028W 3102 nt2.34□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 SSD1YDR293C 3753 nt2.34□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 PTC5YOR090C 1719 nt2.34□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 NUP100YKL068W 2880 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 REV1YOR346W 2958 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YDL041WYDL041W 354 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YDR269CYDR269C 324 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 AYR1YIL124W 894 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 PET191YJR034W 327 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YML084WYML084W 309 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 LSM7YNL147W 348 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 VMA9YCL005W-A 222 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 EDS1YBR033W 2760 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 PHO2YDL106C 1680 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YPP1YGR198W 2454 nt2.33□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YEL043WYEL043W 2871 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 NCL1YBL024W 2055 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 MZM1YDR493W 372 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 TWF1YGR080W 999 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YLR334CYLR334C 381 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YNL010WYNL010W 726 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 ERP4YOR016C 624 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 ROX1YPR065W 1107 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YSW1YBR148W 1830 nt2.32□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 PRK1YIL095W 2433 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 SAP185YJL098W 3177 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 PSD2YGR170W 3417 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YJL070CYJL070C 2667 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 CBF2YGR140W 2871 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 SHE2YKL130C 741 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YOR392WYOR392W 444 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YBR277CYBR277C 402 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 IRC10YOL015W 1761 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 MPH1YIR002C 2982 nt2.31□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YFH1YDL120W 525 nt2.3□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YRB1YDR002W 606 nt2.3□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 FMP16YDR070C 282 nt2.3□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 SWF1YDR126W 1011 nt2.3□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YHR138CYHR138C 345 nt2.3□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 NFU1YKL040C 771 nt2.3□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 IPT1YDR072C 1584 nt2.3□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 SPC72YAL047C 1869 nt2.3□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 NAN1YPL126W 2691 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 MSS11YMR164C 2277 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 MRP10YDL045W-A 288 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YDR250CYDR250C 276 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 VOA1YGR106C 798 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 RPS22BYLR367W 393 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YMR320WYMR320W 306 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YMR324CYMR324C 243 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 EGD1YPL037C 474 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YBR285WYBR285W 435 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 TUS1YLR425W 3924 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 INO80YGL150C 4470 nt2.29□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 TAE2YPL009C 3117 nt2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.1 ms