Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 CGI121YML036W 546 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YOR050CYOR050C 348 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 SPC72YAL047C 1869 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 RRP12YPL012W 3687 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 GIN4YDR507C 3429 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 BNR1YIL159W 4128 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 NMD2YHR077C 3270 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 NUP120YKL057C 3114 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 TWF1YGR080W 999 nt2.69□□□□□ -1.98
NIC96P34077 JIP3YLR331C 378 nt2.69□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.69□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.69□□□□□ -1.98
NIC96P34077 MRPL50YNR022C 420 nt2.69□□□□□ -1.98
NIC96P34077 LCL1YPL056C 306 nt2.69□□□□□ -1.98
NIC96P34077 ECM29YHL030W 5607 nt2.68□□□□□ -1.98
NIC96P34077 RPL27BYDR471W 411 nt2.68□□□□□ -1.98
NIC96P34077 RPS22BYLR367W 393 nt2.68□□□□□ -1.98
NIC96P34077 RPL6AYML073C 531 nt2.68□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YOR121CYOR121C 306 nt2.68□□□□□ -1.98
NIC96P34077 HEH2YDR458C 1992 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 GNT1YOR320C 1476 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 KRE33YNL132W 3171 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YGR035CYGR035C 351 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YGR107WYGR107W 450 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YMR324CYMR324C 243 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 CYR1YJL005W 6081 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 MKT1YNL085W 2493 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 COX1Q0045 1605 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 MSS11YMR164C 2277 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YIL169CYIL169C 2988 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YKU80YMR106C 1890 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 NUP100YKL068W 2880 nt2.67□□□□□ -1.98
NIC96P34077 RRP6YOR001W 2202 nt2.66□□□□□ -1.98
NIC96P34077 SWT1YOR166C 1377 nt2.66□□□□□ -1.98
NIC96P34077 TAE2YPL009C 3117 nt2.66□□□□□ -1.98
NIC96P34077 snR79snR79 84 nt2.66□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YDR209CYDR209C 414 nt2.66□□□□□ -1.98
NIC96P34077 MRPL31YKL138C 396 nt2.66□□□□□ -1.98
NIC96P34077 RPS18BYML026C 441 nt2.66□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.66□□□□□ -1.98
NIC96P34077 OSW7YFR039C 1533 nt2.66□□□□□ -1.98
NIC96P34077 NUM1YDR150W 8247 nt2.65□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YDR250CYDR250C 276 nt2.65□□□□□ -1.99
NIC96P34077 SMD1YGR074W 441 nt2.65□□□□□ -1.99
NIC96P34077 NOP10YHR072W-A 177 nt2.65□□□□□ -1.99
NIC96P34077 MSL1YIR009W 336 nt2.65□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YMR320WYMR320W 306 nt2.65□□□□□ -1.99
NIC96P34077 CDC24YAL041W 2565 nt2.65□□□□□ -1.99
NIC96P34077 KAP123YER110C 3342 nt2.65□□□□□ -1.99
NIC96P34077 DBP10YDL031W 2988 nt2.64□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YER121WYER121W 345 nt2.64□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YER181CYER181C 324 nt2.64□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.64□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.64□□□□□ -1.99
NIC96P34077 RPS22AYJL190C 393 nt2.64□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YKL136WYKL136W 399 nt2.64□□□□□ -1.99
NIC96P34077 ORC2YBR060C 1863 nt2.64□□□□□ -1.99
NIC96P34077 TUS1YLR425W 3924 nt2.63□□□□□ -1.99
NIC96P34077 BFA1YJR053W 1725 nt2.63□□□□□ -1.99
NIC96P34077 DIE2YGR227W 1578 nt2.63□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.63□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.63□□□□□ -1.99
NIC96P34077 FMP23YBR047W 528 nt2.63□□□□□ -1.99
NIC96P34077 CDC50YCR094W 1176 nt2.62□□□□□ -1.99
NIC96P34077 TMA22YJR014W 597 nt2.62□□□□□ -1.99
NIC96P34077 ABM1YJR108W 372 nt2.62□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YOR146WYOR146W 306 nt2.62□□□□□ -1.99
NIC96P34077 RTC6YPL183W-A 282 nt2.62□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YPL216WYPL216W 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
NIC96P34077 VPS35YJL154C 2835 nt2.62□□□□□ -1.99
NIC96P34077 SOK2YMR016C 2358 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 EDS1YBR033W 2760 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 AFI1YOR129C 2682 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 LSO2YGR169C-A 279 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 URM1YIL008W 300 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 EGD1YPL037C 474 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YME2YMR302C 2553 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 ESC1YMR219W 4977 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 KAR3YPR141C 2190 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 CDC53YDL132W 2448 nt2.61□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.6□□□□□ -1.99
NIC96P34077 FCF2YLR051C 654 nt2.6□□□□□ -1.99
NIC96P34077 SMA2YML066C 1110 nt2.6□□□□□ -1.99
NIC96P34077 SNC2YOR327C 348 nt2.6□□□□□ -1.99
NIC96P34077 RPL33AYPL143W 324 nt2.6□□□□□ -1.99
NIC96P34077 KEL2YGR238C 2649 nt2.59□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YDR239CYDR239C 2364 nt2.59□□□□□ -1.99
NIC96P34077 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.59□□□□□ -1.99
NIC96P34077 SNC1YAL030W 354 nt2.59□□□□□ -1.99
NIC96P34077 PAU8YAL068C 363 nt2.59□□□□□ -1.99
NIC96P34077 VTI1YMR197C 654 nt2.59□□□□□ -1.99
NIC96P34077 PAU20YOL161C 363 nt2.59□□□□□ -1.99
NIC96P34077 ACM1YPL267W 630 nt2.59□□□□□ -1.99
NIC96P34077 MSB2YGR014W 3921 nt2.59□□□□□ -1.99
NIC96P34077 SRO77YBL106C 3033 nt2.59□□□□□ -2
NIC96P34077 SGD1YLR336C 2700 nt2.59□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.1 ms