Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KRW8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KRW8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KRW8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KRW8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KRW8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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